华大基因1亿美金启动千种动植物基因组测序
2010-04-15 00:00:00.0
2010年1月11日，来源：Genomeweb
华大基因将投资1亿美金启动一项新工程，包括计划于未来2年内为1千种重要动植物进行测序，并从科学界征集测序物种的提案。由华大基因组织，国际专家组成的委员会将从各地研究者的提案中挑选测序物种，评选条件包括物种的重要性，申请人的资金状况，项目的科学水平，以及实验设计。该委员会将根据资金的情况建议相关的测序方法，并且界定参考基因组的标准，华大基因将利用自身的高通量测序和分析平台提供测序服务。同时，华大基因计划为某些感兴趣的物种研究提供全额资助，其他物种研究将根据申请者的资金条件进行，华大基因协调各方申请者的资金以实现资源优化配置的目的。
华大基因科技合作事业部副负责人李卓表示：“通过许多概念验证研究证明，测序技术已经成熟，总成本在一个可控制的范围内。”李卓说：“虽然华大基因1亿美金的投入使该项目站在一个高的起点上，但是额外的资金融入对于完成整个项目也是必不可少的。”他并未透露预计的资金总额数。李卓进一步指出，“该项目将为被测序物种的各种研究提供可靠的基础，比如表观基因组学和转录组学研究等。另外，世界各地、各领域的科学家们可以利用这些公开数据来培育高产的粮食作物品种和优质的畜牧品种。”
华大基因两年前启动的“生命之树”计划旨在为具有经济和科学研究价值的动物和模式生物测序，迄今已经完成二十多种参考基因组。目前北极熊和企鹅基因组计划还在顺利进行中。比如上个月，华大基因与青海大学合作的藏羚羊基因组计划中，测序已经完成，但研究还在进行中。
同样在上月，华大基因发表了大熊猫基因组重测序组装论文，实验全部在Illumina平台上完成（详见2009年12月15日“测序”栏目）。
去年秋初，华大基因和其他单位共同合作完成了黄瓜基因组计划，这项通过Sanger毛细管测序技术和Illumina技术完成的计划耗资330万美金（详见2009年11月3日“测序”栏目）。
该项目是大规模建立真核生物参考基因组的重大项目之一。例如去年，以加州大学David Haussler为首的科学家，联合Santa Cruz等合作方共同发起Genome 10K计划，将利用新一代测序技术绘制上万种脊椎动物的基因组图谱（详见2009年11月10日“测序”栏目）。