自2007年落户深圳以来，华大基因在学术研究上屡创突破，占据科研制高点。2013年，华大基因发表SCI论文196篇，其中第一作者或者通讯作者论文为122篇；发表在《自然》及其子刊的论文为32篇，《科学》3篇，其中第一作者或者通讯作者论文29篇。此外，据亚太自然出版指数（Nature Publishing Index Asia Pacific）2013年1月21日-2014年1月20日数据显示，华大基因在中国、亚太科研机构榜单中分别名列第5名和第17名。

作为民营科研机构，华大基因始创跨组学平台，积极推动组学研究发展，科研质量不断提升。自然出版集团自2011年起发布《中国自然出版指数》报告，华大基因每年均名列国内科研机构前十名。在生命科学领域，华大基因更位居全国第二。源源不断的前沿科学发现将促进服务于人类健康、动植物育种等领域的应用转化。

2014年，华大基因将继往开来，发展生命科学、加速应用实践、改善民生。