第六届亚洲计算生物学及组学青年学者会议在深隆重召开

20121220日,第六届亚洲计算生物学及组学青年学者会议(AYRCOB)在深圳华大基因研究院隆重召开。本次会议由来自澳大利亚、中国、新加坡、日本、韩国和台湾六个国家或地区的科研机构共同主办。为期两天的会议为青年科学家们提供了一个良好的交流探讨机会,同时也对促进计算生物学和系统生物学等领域的国际合作具有重要意义。

 

会议开始,华大基因主席杨焕明教授致开幕词,并向所有出席本次会议的人员表示热烈欢迎。随后,杨焕明教授围绕新技术和合作的重要性,向大家做了题为《测序、基因组学及人类未来》精彩报告。他表示:“测序技术是生命科学领域十分强大的研究工具,有助于我们更好的认识生命,并将会给人类带来更加光明的未来。他指出:“自然灾害反复提醒,我们是一个大家庭,我们需要同舟共济。当你一个人不能完成时,合作可以助你一臂之力;当你能够实现时,合作可以使你做的更大、更好。只有双赢的合作才能帮助我们构建一个更加美好的未来。”

 

作为主题发言人之一,日本理化研究所(RIKEN)定量生物学中心单细胞基因动态实验室负责人Yuichi Taniguchi博士介绍了他们团队在单细胞蛋白质组、转录组以及mRNA动态等方面的最新研究进展及研究中所面临的挑战。他介绍到,蛋白质和mRNA通常以低拷贝数存在,在单细胞水平很难检测。为了克服这个困难,他们使用新构建的大肠杆菌黄色荧光蛋白融合文库,在单个细胞中进行了定量系统水平的分析。

 

从提高生物乙醇等生物燃料产出量的视角出发,南洋理工大学的Binbin Chen博士分享了他们利用酵母ATP结合盒(ABC)来减少生物燃料毒性的研究。烷类等毒性产物通常对与生物燃料产量相关的有益微生物是非常有害的。在报告中,Chen博士介绍了他们的研究思路及最新成果,并且希望他们的研究能够应用于设计微生物中的烷类耐受性,以更好地提高生物燃料的产量。

 

在“进化和基因组变异”的主题会议中,来自加利福尼亚大学、东京大学以及韩国科学技术院的研究人员给大家带来了一系列精彩的报告。Junko Tsuji博士讲述了《哺乳动物基因组中线粒体假基因的综合分析》,并详细介绍了人类、恒河猴、小鼠及大鼠中染色质和基因组内容的一些总体特征;Junho Kim 博士分享他们的最新研究成果,指出体细胞缺失(somatic deletions)可能会影响脑部发育,并且和精神分裂症可能有很大关系。

 

来自台湾元智大学的Kai-Yao Huang博士和Min-Gang Su博士分别介绍了他们蛋白质生物学相关的资源和数据库研究。Huang博士讲述了他们开发的最新算法——SplicePred,该算法是首个用于鉴定RNA剪切相关蛋白的在线资源,目前可通过http://csb.cse.yzu.edu.tw/SplicePred/免费访问。Su博士介绍了数据库——topPTM,该数据库整合了从可获取的数据库和已发表论文中得到的实验验证的翻译后修饰(PTM)位点,以及这些PTM位点跨膜蛋白结构拓扑学的注释信息。

 

会议接下来将围绕网络生物学、基因调控和小RNA、生物医学信息学等展开,更多精彩的报告包括:《用于研究植物复杂性状的基于网络的拟南芥遗传学系统》、《多样性基因组数据的内关联、外关联以及整合计算生物学》、《基于高通量测序的小RNA》以及其他一些报告。

 

详细信息见http://2012.ayrcob.org/