华大科技率先成功推出TruSeq微量转录组技术服务——转录组建库起始量低至200ng

 

201294日,华大基因旗下全资子公司——华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内率先推出微量真核转录组测序技术服务—TruSeq微量转录组。该技术在国内首次通过TruSeq RNA试剂盒成功实现转录组的微量建库,总RNA建库起始量低至200ng,突破了微量或珍贵样品进行常规转录组建库风险高、成功率低的瓶颈,实现了高效、稳定的微量转录组测序,将有助于更好地推动功能基因组学研究。

 

转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下所有基因转录产物的总和,是连接基因组遗传信息与蛋白质组生物功能的纽带。基于新一代测序平台的转录组研究,能够全面快速的获取某一物种特定器官或组织在某一状态下几乎所有转录本序列信息,进而解决新基因深度发掘、低丰度转录本发现、转录图谱绘制、可变剪接的调控、代谢途径确定、基因家族鉴定及进化分析等各方面的问题。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,目前已经被广泛应用于基础生物学、医学、农学等领域。

 

然而,目前常规转录组建库对样品量的要求较高,致使许多达不到最低样品量要求的样品无法进行常规建库,比如来源稀少的干细胞、肿瘤等临床样本,弥足珍贵的考古样本以及一些RNA提取困难、容易降解的特殊样品。对于这些样品量不足的样品即使能够建库成功,也会对测序的质量有所影响,且同一个体在不同生长时期及生长环境下基因表达情况有所差异,混合样品建库又会影响分析结果。这使得RNA样品量不足成为制约转录组研究的重要瓶颈之一。

 

鉴于此,华大科技研究人员结合丰富的转录组建库、测序经验,使用TruSeq RNA试剂盒,经过一系列的技术优化,成功实现了微量样品的转录组建库测序。相比于常规转录组至少5μg的建库起始量,使用TruSeq微量转录组,研究人员只需从样品中提取出200ng的总RNA,便可进行建库、测序及后续信息分析。该技术不仅在建库起始量上取得突破,也极大的提高了测序数据的质量。同时,该技术还采用磁珠纯化的方式,大幅度缩短了建库时间,提高了实验效率。TruSeq RNA微量转录组的使用,可方便科研人员有效获取某一物种特定微量或珍稀样本在某一状态下几乎所有转录本序列信息,为后续的基因功能等研究奠定基础。

 

华大科技RNA产品部总监高强博士表示:“转录组测序已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域,华大科技在国内领先推出TruSeq微量转录组,为更多珍稀的样品进行基因结构、功能以及后续的研究奠定基础。我们很高兴在功能基因组学特别是转录组学研究方面一如既往的为客户提供最先进、最优质的服务。”