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蒙古高原四个特色物种全基因组序列图谱绘制完成
2011年8月9日,由内蒙古农业大学内蒙古自治区生物制造重点实验室暨内蒙古自治区高校动物生物技术重点实验室和深圳华大基因研究院联合宣布阿拉善双峰驼、蒙古羊、蒙古牛和蒙古马全基因组序列图谱绘制完成。这是我国科学家首次独立完成的、具有自主知识产权的蒙古高原物种的全基因组序列图谱,标志着我国家畜种质研究在基因组学领域又迈进重大的一步。该项目是内蒙古特色物种基因组项目的一部分,也是华大基因“千种动植物基因组计划”的启动项目之一。 阿拉善骆驼、蒙古羊、蒙古牛、蒙古马是我国古老的原始品种,为我国畜牧业的主要基础品种。我国育成的众多地方品种均有这些品种的血液。这些古老品种经过长期的自然和人工选择后,形成了生活力强、抗寒、耐热、耐旱、耐粗饲、生长发育快、畜产品品种优、抗病力强等特点。这些优良的家畜品种成为种质创新和新品种培育的重要资源,同时也成为分子遗传学、发育遗传学与群体遗传学研究的理想物种资源。 近年来,作为我国最大的畜牧业生产基地,内蒙古自治区畜牧业发展面临着载畜量过高、天然草场退化、发病率高、良种化比例低、个体生产能力低下等制约因素。转变生产方式,从过去的数量增长向质量增长是一个重要的解决思路。通过基因组学研究及分析,可以深入了解家畜的生物学特性和经济性状的分子调控机理,充分发挥特色物种的各种遗传潜力,对于提高其生产性能,加快优良品种的培育和改良,提高生产能力,提高农业现代化水平,提升自治区畜牧业竞争力都有重要的现实意义。 蒙古高原四个特色物种全基因组序列图谱的绘制完成对蒙古高原四个特色物种的繁育、抗逆、肉质、毛品质等重要经济性状的遗传基础研究具有重要的科研价值,同时为生产出更优质的肉、奶、毛、皮、绒等畜产品提供了强有力的科技支撑。此外,通过对四个特色物种的基因组学研究,可以更加全面地解读四个特色物种的遗传奥秘,从而研究我国羊、牛、马、骆驼的起源、进化,为我国的家畜种质资源的保护、开发和利用奠定重要基础。2011-08-09 00:00:00.0
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华大基因助力广东鹤山打造“幸福共享之城” “共建幸福鹤山”框架协议签约仪式 暨新闻发布会隆重举行
2011年8月9日,广东省鹤山市政府与深圳华大基因研究院“共建幸福鹤山”框架协议签约仪式暨新闻发布会在广东省鹤山市隆重举行。广东省鹤山市市委书记郭伟、市长黄国常、深圳华大基因研究院院长汪建以及鹤山市和华大基因有关领导出席签约仪式。协议的签署,标志着广东省鹤山市与深圳华大基因研究院在人类健康等领域的合作全面展开。 记者了解到,自去年以来,广东鹤山市为更好贯彻落实广东省委省政府“加快转型升级,建设幸福广东”的战略部署,紧密围绕“争转型升级之前,创幸福共享之城”的工作思路,决定依托深圳华大基因研究院世界一流的基因组研究技术与产业孵化平台,为鹤山市妇女儿童健康保驾护航,推动鹤山幸福共享之城建设,并借此推动鹤山现代服务业的发展。 据相关人士透露,双方在民生健康方面的合作主要包括适龄妇女宫颈癌与新生儿遗 传类疾病的筛查,同时双方将搭建“鹤山市居民健康信息化平台”,通过此平台把筛查工作与建立居民电子健康档案相结合,推动鹤山市新医改的医疗信息化建设。 此外,华大基因研究院科学与技术团队还受邀深入到鹤山广大干部与群众中,开展生命科学与临床医学以及健康管理等方面的系列知识讲座和技术培训。 框架协议签订的同时,“鹤山市10万适龄妇女HPV筛查项目”也即时启动,鹤山市将成为全国第一个覆盖全区域适龄妇女的子宫颈癌早期筛查示范点。按照工作计划,到2013年底,鹤山市民中的约10万适龄妇女在遵循自愿的前提下,将得到HPV筛 查服务,首批1万育龄妇女筛查阳性者还将享受免费保健与干预管理。此项目紧紧围绕国家“十二五”规划提出的“为群众提供满意的基本医疗卫生服务”要求,和医改回归“公益性”的核心理念,将会极大推动鹤山市基层妇女保健工作,提高基层医务人员的相关医疗技能,使鹤山市广大育龄妇女成为“共建幸福鹤山”的最直接受益人。 据了解,随着2011年 “十二五”规划拉开大幕,中央政府提出了更高标准的“民生”规划。深圳华大基因研究院在基因组学领域勇攀高峰,在基因科研的发展和基因技术的创新中处在世界前列。借国家大力改善民生的契机,深圳华大基因研究院也着力运用创新基因技术助力国家民生工程,使更多民众在健康等方面受惠于基因科技的发展,提升民众健康指数,以期在人类健康事业上为社会做出更大贡献。 深圳华大基因研究院相关负责人表示,为鹤山人民的健康幸福,深圳华大基因研究院率先在广东省鹤山市开展区域健康管理试点,努力降低鹤山市育龄妇女重大疾病发生率、新生儿出生缺陷率、遗传类疾病发生率等,让鹤山人民共享基因科技的便利和“幸福鹤山”的成果。华大基因期望由此探索出一整套基因服务人民的区域化健康管理模式,以鹤山为基地大力拓展健康产业。 附:广东省鹤山市介绍 鹤山市国土面积1083平方公里,下辖10个镇,户籍人口36万,总人口59万,境外华侨30多万,隔西江与佛山的南海、顺德相望,距广州1小时车程,是广州、佛山通往阳江、湛江、广西的咽喉要道。境内路网密布,佛开高速、江鹤高速、江肇高速、325国道贯穿其间。未来5年,江罗高速、广珠铁路、南沙铁路、广珠轻轨将陆续建成。2010年全市生产总值168亿元,地方财政一般预算收入12.26亿元。 经过多年的发展,鹤山已经形成了电子信息、绿色光源、机械制造、金属制品等支 柱产业,是我国的印刷产业基地、男鞋生产基地和五金水暖卫浴产业基地。目前,广珠铁路正在建设,经批准的珠三角最大物流中心鹤山国际物流中心也将随铁路的 建成投入运营。鹤山现有多家星级酒店,包括碧桂园凤凰酒店、银业雁山酒店两家五星级酒店。已开发大雁山风景区、古老水乡、腾龙峡漂流、东坡亭、铁夫画阁等 旅游度假区和人文景观。鹤山是全国绿化百佳县(市),也是广东省首批五个林业生态县之一,婉约多情的西江绕城而过,给鹤山增添了南国水乡的姿彩。鹤山自古 英才辈出,先后诞生过咏春拳一代宗师梁赞先生、被尊为“中国油画第一人”的李铁夫先生和第一个“中国电影皇后”的胡蝶女士等。 当前,全市人民正“争转型升级之先,创幸福共享之城”,为建设岭南特色宜居城市而努力奋斗。2011-08-09 00:00:00.0
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德国致病性大肠杆菌研究成果在《新英格兰医学》杂志发表
2011年7月28日,由深圳华大基因研究院、德国汉堡—埃普多夫大学医学中心、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所等单位主导完成的德国致病性大肠杆菌国际合作研究成果在国际著名杂志《新英格兰医学》(The New England Journal of Medicine,NEJM)上在线发表(http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1107643)。 德国致病性大肠杆菌研究项目首次展示了快速的基因组测序技术和及时的数据共享给全球各科研领域所带来的巨大贡献,证实了信息数据的快速共享在公共卫生事件中可发挥至关重要的作用,同时也为应对全球重大突发性紧急公共卫生事件提供了一个全新的解决思路。 在此次疫情中,华大基因和德国汉堡—埃普多夫大学医学中心的研究人员以最快的速度完成对致病菌的基因组测序及分析并向全球免费公开所有数据,并声明在公共领域许可证范围内,所公开的数据没有使用限制。该数据库的公开使得整个科学界在第一时间共享了相关数据信息 (http://www.sciencemag.org/content/332/6035/1249.full),省去了从数据产生到文章发表的时间,为了尽快控制疫情奠定了重要的科学基础。 据了解,华大基因的相关研究人员在收到样品后,3天内完成了大肠杆菌基因组的测序和初步组装,确定该菌株属于血清型O104,并及时将相关基因组序列数据公开分享,促进了全球生物信息学家的通力合作;在数据发布的24小时之内,完成了对该大肠杆菌的基因组组装;在数据发布的2天后,研究人员发现引起此次爆发的菌株与2001年在欧洲分离的菌株01-09591及2002年的中非分离株55989有高度相似性并展开进一步分析比较;5天后,研制出该大肠杆菌的诊断试剂盒并向全球范围内无偿提供检测实验方案及所需引物序列信息;2周内全球的研究人员在维基百科中公开了24篇关于该菌株的毒力、抗性基因、进化等方面最新的研究报告。 华大基因微生物项目负责人覃俊杰博士说:“为尽快揭示德国大肠杆菌的致病机理及控制疫情的恶化,我们与合作方共同决定采用这种快速的数据共享方式,及时公开我们获得的相关数据,希望能够为全球生物信息学家及流行病研究学者的广泛合作提供基础支持,加速对该致病性大肠杆菌的研究进程。” 军事医学科学院微生物流行病研究所全军微生物检测研究中心主任、国家“973”首席科学家、国家科技重大专项课题负责人杨瑞馥教授补充说:“该研究成果不仅对德国致病性大肠杆菌的进化起源和致病性等方面的研究打下了坚实的基础,更为重要的是为全球其他传染性疾病的应对机制提供了一个新的国际协作模式。” 华大基因研究院副院长王俊教授表示:“基因组测序为鉴定和了解新型病原奠定了重要的基础,信息数据的免费、快速发布及共享能够极大地加速疾病诊断和治疗的过程,对大规模突发性公共卫生事件的快速应对具有十分重要的意义。” 德国负责传染病监督及预防的罗伯特-考赫学院7月26日宣布,肠出血性大肠杆菌疫情在德国的爆发已经结束。这场疫情最终导致德国范围内50人死亡,仅汉堡医院就有3496名病人被诊断为感染肠出血性大肠杆菌,在德国以外的欧洲地区也发现了76名患者。 另据悉,华大基因(BGI)和BioMed Central(简称 BMC ,生物医学中心)共同主办的《GigaScience》杂志已开始征集投稿并计划于今年11月份正式上线。该杂志是一个面向所有使用或产出海量数据的生物学研究者的开放阅读期刊,主要采用全文文献与大型数据库相结合的崭新模式,为广大科学工作者提供前沿、有效的数据以及生物学发现等资源。具有DOI的德国大肠杆菌基因组数据库使得大肠杆菌成为第一个以这种方式公开数据的物种。此外,研究人员也可以按照同样的方式向数据库中添加已经经过证实的有价值的信息,以不断更新研究发现,并促进全球科学的快速发展。 (http://bacpathgenomics.wordpress.com/2011/06/13/e-coli-data-released-under-creative-commons-0-license/)。 更多信息请见: 华大基因“德国大肠杆菌”数据库:http://dx.doi.org/10.5524/100001 德国大肠杆菌数据分析:https://github.com/ehec-outbreak-crowdsourced/BGI-data-analysis/wiki 已发布的相关新闻: 从德国致病性大肠杆菌到濒临灭绝的北极熊 《GigaScience》将最先为 科学界提供可引用数据 http://www.genomics.cn/news_show.php?type=show&id=1331 深圳华大基因研究院研制完成德国大肠杆菌检测试剂盒,并免费向全球疾病控制和研究机构提供检测方案和引物信息 http://www.genomics.cn/news_show.php?type=show&id=1264 基因组分析结果揭示新型超毒性大肠杆菌导致德国疫情爆发 http://www.genomics.cn/news_show.php?type=show&id=1252 德国爆发大肠杆菌已发现8种抗生素的抗性基因 http://www.genomics.cn/news_show.php?type=show&id=1260 致命大肠杆菌起源新线索 http://www.genomics.cn/news_show.php?type=show&id=12622011-08-09 00:00:00.0
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膀胱癌研究成果在《自然—遗传学》杂志发表诊断、治疗提供新思路
——研究成果在《自然—遗传学》杂志发表 2011年8月8日,由北京大学深圳医院和深圳华大基因研究院主导完成的研究成果——“膀胱移行细胞癌中染色质重塑相关基因突变的研究”(Frequent mutations of chromatin remodeling genes in transitional cell carcinoma of the bladder)在国际著名杂志《自然—遗传学》(Nature Genetics)上在线发表(http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/abs/ng.907.html),该研究指出染色质重塑异常可能是导致膀胱癌发生的一个重要标志,为膀胱癌的诊断、治疗奠定了坚实的遗传学基础。 膀胱癌是目前世界上第九大癌症,每年约有15万人死于膀胱癌。膀胱移行细胞癌(TCC)是膀胱癌中最常见的组织学类型,男性发病率约为女性的3~4倍,多发生于40-70岁之间。膀胱癌在中国的发病率和死亡率均占泌尿系肿瘤的首位,目前,中国男性膀胱癌的年发病率已达十万分之八,并呈逐年上升的趋势。 文章第一作者、北京大学深圳医院桂耀庭博士说:“目前,国内外还未曾对膀胱移行细胞癌进行系统、全面的基因组学分析,我们希望通过本次研究,发现一些与膀胱癌相关的新基因,为该病的诊断、治疗提供更多有价值的信息。在本研究中,我们对9例TCC患者样本进行了外显子测序研究,并在88例TCC患者样本中进行验证,发现54个与TCC发生相关的显著突变基因,其中49个基因是首次在膀胱癌中被发现。” 染色质重塑(chromatin remodeling)是表观遗传修饰模式中的一种重要机制,其中的任何一个环节发生异常都会影响基因的正常表达,从而引起很多复杂的疾病。如果突变引起抑癌基因或调节细胞周期的蛋白出现异常,则可能会导致癌症的发生和发展,所以研究人员对膀胱移行细胞癌中染色质重塑相关基因进行了研究。 在测序结果中,研究人员发现了8个与染色质重塑相关的突变基因,除了UTX基因外,其他7个突变基因在原发性膀胱移行细胞癌中是首次被发现。在97例TCC患者样本中,有59%的患者的染色质重塑相关基因发生了体细胞突变,由此研究人员推测染色质重塑异常可能是导致TCC发生及发展的重要机制之一,这为目前难以医治的肿瘤提供了新的分子靶点。 深圳华大基因研究院副院长王俊说:“该研究是第一次全面地对膀胱移行细胞癌的遗传性变异情况进行研究及分析,为日后更深入地开展膀胱癌研究奠定了良好的基础。另外,此次研究也充分说明了表观遗传学在癌症研究中的重要性及必要性。”2011-08-08 00:00:00.0
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华大捐赠十万人次已婚育龄妇女HPV宫颈癌筛查
深圳华大基因研究院向广东省流动人口捐赠10万人次已婚育龄妇女HPV普查服务 广东省流动人口十万例已婚育龄妇女HPV免费筛查第一站深圳开启 2011年8月5日,“广东省流动人口已婚育龄妇女HPV普查”活动第一站在深圳市龙岗区开启。 为发挥社会力量,整合社会资源,促进中国人口与经济、社会、资源和环境持续协调发展,增进人口福利和家庭幸福,共同为共建和谐社会做出贡献,深圳华大基因研究院向中国人口福利基金会捐赠广东省流动人口捐赠10万人次已婚育龄妇女HPV普查服务,此活动的开启将意味着“广东省流动人口十万例已婚育龄妇女HPV免费筛查项目”设立,深圳市1万人次已婚育龄妇女将得到免费宫颈癌HPV筛查。 据深圳华大基因研究院相关负责人介绍,根据中国人口福利基金会要求,深圳华大基因研究院向广东省流动人口捐赠10万人次已婚育龄妇女HPV普查服务。广东省给予广州、深圳、珠海、佛山、惠州、东莞、中山、江门、肇庆、清远等十个地级以上市分别实施1万例HPV普服务。此次活动的筛查对象为无违反计划生育政策的流动人口已婚育龄妇女,旨在筛查项目点流动人口已婚育龄妇女HPV病毒患病情况,指导患病群众进行治疗,降低宫颈癌的发生率。 当日,深圳市龙岗区龙城街道爱联社区嶂背工业区赐昱生育中心内人头蹿动,领取HPV免费筛查表格的妇女络绎不绝,她们脸上洋溢着笑容,表示自己拥有此福利感到高兴,更为华大基因质优快速的服务表示感谢。 据悉,随着2011年“十二五”规划拉开大幕,中央政府提出了更高的“民生”计划后,深圳华大基因研究院在基因组学领域勇攀高峰,引领科学的发展和技术的创新,深圳华大基因研究院利用世界领先的高通量基因测序方法,质优快速地检测HPV病毒,预防妇女宫颈癌,在人类健康事业上做出了令世人瞩目的成绩。 与此同时,深圳华大基因研究院将大力宣传HPV宫颈癌预防的知识,指导患病妇女进行预防,建立普查跟踪体系,开展HPV宫颈癌及妇女保健工作,降低宫颈癌的发生率。通过此次的筛查工作的展开,将更早的发现HPV病毒的感染,从而起到预防宫颈癌的作用,造福深圳妇女,造福广东妇女,造福全国妇女。2011-08-05 00:00:00.0
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汪建院长携华南片区代表前往佛山市访问考察 共谋发展合作
2011年8月1日,深圳华大基因研究院院长汪建和副理事长龙岳华携华南区第一负责人尹烨、华南区第二负责人彭智宇、华南区战略总监林梁等一行6人应邀前往佛山市访问考察。广东省副省长、原佛山市委书记陈云贤、佛山市副市长李子甫、佛山市经济贸易局局长李坚、佛山市经济贸易局副局长香秀杏等予以热情接待。 汪建院长一行首先与陈云贤副省长进行了会面,陈云贤副省长对华大的回访表示欢迎,希望华大能深入了解佛山市,并就相关项目进行长远合作。 在李子甫副市长的主持下,华大访问团与佛山市卫生局局长戚耀方、佛山市妇幼保健院院长郭晓玲、佛山市第一人民医院副院长张斌、佛山市第二人民医院院长李蜀光、佛山市中医院院长陈志维及佛山各区经贸局局长和代表进行了座谈。座谈中,汪建院长详细介绍了华大历史及华大的学术成果、科研技术和产业成就。汪建院长说,华大基因希望用最小的资源支撑、最前沿的科技、最大资源配置,实现最好的社会影响力及最可持续发展的经济目标,欢迎佛山各界人士亲自到华大参观访问,加深了解,共谋发展。随后双方针对佛山市的产业结构特点,就当地医疗卫生健康服务、建设具有地域特色的示范性项目和花卉育种等话题进行了热烈讨论和深入探讨。 双方表示,将在增进了解的基础上,以改善民生、促进经济发展为目的,寻找相关项目进行进一步交流与合作,共同为促进佛山市生物医药产业发展,提高人民健康医疗水平做贡献。2011-08-05 00:00:00.0
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广东省科技厅调研华大 就产学研资联盟相关事宜交流探讨
2011年8月3日上午,广东省科技厅产学研结合处副处长张志彤、科长曾颢、张展生、周慊与深圳市科工贸信委处长王立新、副处长于英普、科长徐秋林一行调研华大,来宾参观了华大展厅,了解了华大的科学研究以及产业的发展情况,随后,来宾与深创投、产学研的相关负责人等、华大基因研究院院长汪建、行政总裁黄胜全、副理事长龙岳华等就产学研资联盟的相关事宜进行了座谈。 今年6月份,深圳基因产学研资联盟在第五届中国生物产业大会上隆重揭牌,受到广东省委、省政府及深圳市委、市政府的高度重视。近日,广东省委书记汪洋做出重要批示。深圳市委副书记、市长许勤在华大现场办公会上指出,在华大基因发展的关键时期,在深圳战略性新兴产业发展的关键时期,深圳市委、市政府将一如既往加大力度支持华大基因的发展,推动华大基因进一步在技术、理论上有新突破,在产业上有新应用、新发展;使其成为生物科学理论研究的基地、新技术扩散的源泉和产业发展的重要支撑。 张志彤副处长发言时强调,此次调研也是遵从汪洋书记的指示,希望在产学研资方面对华大的发展提供支持。 汪建院长说,华大坚持产学研一体化的发展模式,符合社会发展的规律及科学发展观的总体需求,华大的成功离不开深圳市委、市政府的大力支持。他期望,要形成从标志性的成果到产业标准的过渡,希望省里支持重点实验室,重大科研攻关项目,平台、基地的建设,并希望在农业、水产、林业及医学临床检测方面跟省里重点合作。 省市科技部门有关责任人对华大的发展予以支持,将就产学研资联盟的相关事宜进行更深入的探讨。2011-08-03 00:00:00.0
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无锡国家高新区领导受邀来访华大 赞赏华大产学研发展模式
2011年8月2日,无锡国家高新区管委会副主任刘骁、无锡国家技术创业服务中心主任任桂涛、刘平部长一行受邀到访华大。华大基因研究院院长汪建、生育健康中心第三负责人赵立见、华东片区第三负责人杨爽、美洲华大执行副总裁王学刚博士予以热情接待。 生育健康中心第三负责人赵立见向刘骁副主任一行介绍了华大基地建设模型及近期产业化发展情况,刘骁副主任一行重点了解了无创产前基因检测项目,双方就此项目进行了深入的探讨交流。 座谈会上,刘骁副主任对华大的产学研发展模式表示高度赞赏,并希望就一些技术性的项目寻求共性、开展合作、共同发展。双方就如何促进生命科学相关技术发展与应用交换了意见,就未来可能的合作项目达成了初步的合作意向,刘骁副主任盛情邀请华大基因到无锡就合作事宜进一步协商落实。2011-08-03 00:00:00.0
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华大与华南理工大学就继续探索创新人才培养达成共识
2011年8月2日上午,华南理工大学副校长邱学青、生物与工程学院院长谭文、生物学院副院长林影、教务处副处长吴应良、研究生院副院长刘芳、广东省重点实验室专职副主任樊丽一行来访华大,华大基因研究院院长汪建、助理总裁殷波、人才培养中心彭凤琴、黄晓鹃等予以热情接待。 汪建院长首先为来宾介绍了华大近期的科研方向及进展情况,随后,双方就如何更快、更大规模地合作培养创新人才的问题进行了深入的探讨。 汪建院长说,科技突破、产业突破需要大量优秀人才,学校的现有学科如何在组学研究上延伸,需开阔眼界,创新思维,希望华工能与华大步伐一致,共同培养研究生层次的创新人才,并提出,要在生物学、信息学与测序仪器国产化三方面充分结合双方的教育与科技资源,开展对年轻教师与学生的培养,带动整个学科的建设。 邱学青副校长表示,华工在创新教育上敢于先行先试,在与华大的本科生创新班联合培养方面已经有很好的基础,希望以新成立的创新学院为平台,借助华大的科研力量,继续探索联合培养创新人才。 华大宣传部2011-08-03 00:00:00.0