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中国科学家主导完成的白菜全基因组研究成果于《自然-遗传学》杂志发表
2011年8月29日,由中国农业科学院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所、深圳华大基因研究院主导,英国、韩国、加拿大、美国、法国、澳大利亚等国家组成的“白菜基因组测序国际协作组”(Brassica rapa Genome Sequencing Project Consortium, BrGSPC)共同合作完成的白菜全基因组研究成果(The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa)在国际权威杂志《自然-遗传学》(Nature Genetics)上在线发表(http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/abs/ng.919.html)。这是由中国科学家主导,通过国际合作完成的又一重大成果,标志着我国以白菜类作物为代表的芸薹属作物基因组学研究取得了国际领先的地位。 白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的一大类蔬菜,其中结球白菜和小白菜是我国栽培面积和消费量最大的蔬菜作物。我国是世界最大的白菜生产国,目前大白菜和小白菜栽培面积已超过400万公顷,总产量约12,000万吨,在我国的蔬菜供应中具有举足轻重的地位。白菜在韩国、日本以及东南亚各国也是主要的蔬菜。此外,白菜(A基因组)还是世界上最主要的油料作物油菜(由AC基因组组成的异源四倍体)和油料蔬菜兼用作物芥菜(由AB基因组组成的异源四倍体)的基本种。因此,白菜全基因组测序的完成对白菜类作物和其它芸薹属类作物的遗传改良具有重要的意义。 据了解,中国农业科学院蔬菜花卉研究所联合油料作物研究所和深圳华大基因研究院于2008年10月启动白菜基因组测序项目,2009年9月鉴于我国开展的白菜基因组测序取得重大进展,BrGSPC正式决定终止原有的所有测序活动,以中国测定的白菜基因组序列为A基因组参考序列。 在完成白菜基因组组装的基础上,我国科学家联合国际同盟进一步开展了白菜基因组注释、比较基因组学、基因组进化和各种相关的生物学分析。分析结果表明,白菜基因组大小为约485Mb(由于重复序列的分布过于集中,因此实际组装的长度为285Mb,基因组覆盖度大于98%),共包含约4万多个基因;白菜的祖先种与模式物种拟南芥非常相似,它们大约在1300-1700万年前发生了分化,两者依然维持着良好的基因之间的线性对应关系;白菜基因组存在3个类似但基因密度明显不同的亚基因组,其中一个亚基因组密度显著高于另外两个亚基因组,推测白菜基因组在进化过程中经历了两次全基因组复制事件与两次基因丢失的过程。研究还发现,白菜在基因组发生复制之后,与器官形态变异有关的生长素相关基因发生了显著的扩增,白菜基因组复制导致了许多与形态变异有关的基因保留更多拷贝,这可能是白菜类蔬菜具有丰富的根、茎、叶形态变异的根本原因,这一成果对研究不同产品器官的形成与发育具有重要价值。 白菜是迄今为止测定的与模式物种拟南芥亲缘关系最近的物种。拟南芥是目前世界上研究的最为透彻的物种,大量的拟南芥基因功能得到了阐明。由于白菜基因与拟南芥基因存在高度的相似性,白菜基因组的测定为利用丰富的拟南芥基因的功能信息架起了桥梁,这为利用模式物种信息进行栽培作物的改良奠定了良好的基础,将极大的促进白菜类作物和其它芸薹属作物的遗传改良。白菜全基因组序列图谱的完成进一步丰富了蔬菜遗传育种理论,有利于促进我国白菜类作物的遗传改良,对巩固和提高我国白菜类作物育种的国际领先地位有着十分重要的作用。 白菜全基因组序列分析的完成是我国农业领域取得的重大新成果,该项目研究得到了科技部基础司、农村司和国际合作司、财政部科教文卫司、农业部科教司、国家自然科学基金委等部委的大力支持。2011-08-29 00:00:00.0
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香港仁安医院访问团应邀来访华大 寻求生育健康相关项目合作契机
2011年8月27日下午,香港仁安医院副医务总监、英国皇家妇产科医学院荣授院士、香港妇产科医学院院士梁国龄等一行组成的仁安医院访问团来访华大,生育健康中心负责人王威等热情接待了来宾。 参观中,生育健康中心负责人王威为仁安医院访问团一行详细介绍了华大的发展历程和科研成果、社会责任与民生项目、人才培养与教育规划等,特别是华大标志性的科研成果以及健康服务等方面的科技突破及应用成果。 随后访问团一行还参观了华大基因组平台与临床实验室。 会谈中,科学技术体系生育健康项目负责人蒋慧对无创产前基因检测项目做了详细介绍。随后,双方就生育健康相关项目的合作进行了深入探讨与展望。香港仁安医院访问团一行希望借助华大的尖端科研平台和先进技术,推动与华大基因生育健康相关项目的合作。 香港仁安医院简介 香港仁安医院由恒基兆业集团策划发展,创院于1994年,是香港第十二间全科私家医院,亦是新界东区首间成立之私家医院。医院于1999年获得ISO 9002品质认证,是首间在审核过程中绝无需改良项目之私家医院,亦是当时全世界少于十间能达此水平的医院。2011-08-27 00:00:00.0
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华大基因生命伦理和生物安全审查委员会研究者培训暨受试者保护工作研讨会顺利召开
2011年8月27日,华大基因生命伦理和生物安全审查委员会(BGI-IRB)研究者培训暨受试者保护工作研讨会在深圳顺利召开。来自各体系各平台的近50位华大研究者参与了本次活动。这些研究者中既有参加华大工作6年多的老华大人,也有新近加入华大的新同事。 在为期一天的培训暨研讨活动中,大家认真听取了杨焕明院士对生命科学研究发展与生命伦理、生物安全问题关系的专题报告,学习了北京大学医学部医学伦理学教授、华大基因生命伦理和生物安全审查委员会委员丛亚丽老师关于科研伦理的讲座,同时还就华大本身研究和产业发展道路中已经面临和可能面临的受试者保护工作和其他伦理、社会和法律问题以“案例讨论”的方式进行了深入研讨。 会上,华大基因生命伦理和生物安全审查委员会的主席郭肇铮、委员张耕耘向与会的研究者们介绍了华大基因生命伦理和生物安全审查委员会的具体工作,解答了研究者提出的关于研究方案设计、研究方案审查、如何更好地保护受试者及研究者本身等问题。对研究者提出的针对国情提供研究方案和实施工作的指导,尽快制定动物研究相关指南、操作规范等要求,郭肇铮老师表示华大基因生命伦理和生物安全审查委员会将集中力量、尽快向研究者递交满意的答卷。 在会后的问卷和讨论中,研究者对本次培训和研讨活动给予了良好评价,提出鉴于受试者保护工作的必要性和重要性,希望为更多的研究者提供类似的培训机会,使华大每一位参与相关研究的研究者都提高对“生命伦理和生物安全”问题敏感性的认识、获得有益知识、指导实际工作。 郭肇铮老师最后总结认为,从各位身上,看到华大人对科学研究和产业推广工作的严肃性和复杂性已经有了深刻的认识,对生命伦理和生物安全工作的重要性和必要性有充分的理解。如何在下一步工作中,充分挖掘和发挥大家的‘实践智慧’、摸索适合华大科研、产业工作的受试者保护(包括实验动物)模式、开展对外交流工作,将是BGI-IRB的紧要课题。希望大家能积极配合和协助委员会的工作,从学员成长为培训者,在不断完善自身研究工作的同时,提高自身的综合能力,也为华大‘民生科技’的发展和‘软实力’的提高贡献自己的力量。2011-08-27 00:00:00.0
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武汉市农科院谭本忠院长、市农科院蔬菜科学研究所副所长柯卫东一行到访
2011年8月24下午,武汉市农业科学技术研究院院长谭本忠、蔬菜科学研究所所长柯卫东一行参观考察武汉华大基因,双方就开展生命科学项目的战略合作进行了探讨交流。 大基因华中区负责人牟峰的热情接待下,谭本忠院长一行走访考察了武汉华大各实验平台及高通量测序实验室,了解了武汉华大正大规模推广普及的人类健康领域新技术,并对谷子、轻木、手工克隆等生命科学项目给予高度评价。 座谈会上,双方就华大分子标记育种和转基因育种成熟技术在莲藕上的运用进行了深入探讨。双方一致表示,农科院的莲藕项目一定要做出大成果,莲藕品牌不仅要做到武汉第一、中国第一,还要走出国门做到世界第一。农科院将全力支持莲藕项目下步研究,与武汉华大签订战略合作协议,筹备成立莲藕研究中心,推动莲藕在科研上和品种上的研究进展,实现双方资源的优势利用。 据悉,莲藕基因组计划由华大基因与武汉市蔬菜科学研究所合作,已与2010年11月启动,预计于今年9月完成莲藕精细图的绘制工作。后续双方将结合华大的测序信息分析优势和蔬菜所的种质资源优势就莲藕的分子育种展开深入合作,进而促成双方从水生蔬菜到武汉市农科院优势特色物种分子育种的全面合作。2011-08-24 00:00:00.0
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国务委员刘延东一行调研华大,支持创新发展
2011年8月24日上午,中共中央政治局委员、国务委员刘延东,中共中央政治局委员、省委书记汪洋一行参观调研华大,陪同参观调研的领导还有全国政协副主席、科学技术部部长万钢,教育部部长袁贵仁,国务院副秘书长江小涓,教育部副部长杜占元,教育部副部长郝平,国办秘书局三局局长陆俊华,首长秘书徐晓萍,国研室教科文卫司副司长侯万军;陪同参观调研的省领导有省委常委、广东省常务副省长朱小丹,省委常委、省委秘书长徐少华;陪同参观调研的市领导有广东省委常委、深圳市委书记王荣,深圳市委副书记、市长许勤,深圳市委常委、市委秘书长王毅,深圳市政府秘书长李平;陪同参观调研的区领导有盐田区委书记、区人大常委会主任郭永航,盐田区委副书记、盐田区人民政府区长杜玲,盐田区委常委、区人民政府副区长王宏彬,盐田区委常委、区委(区政府)办公室主任梁景海等。深圳华大基因研究院理事长、中国科学院院士杨焕明、深圳华大基因研究院院长汪建、行政总裁黄胜全、副理事长龙岳华等予以热情接待。 在汪建院长等人的介绍下,国务委员刘延东一行详细了解了华大科学发展道路和成果、社会责任与民生项目、人才培养与教育规划等内容,包括华大标志性的科研成果、技术体系、国家基因库、健康服务、生物育种、环境应用等方面的科技突破及应用成果。 在介绍华大科技体系时,国务委员刘延东强调了现今基因测序和应用的重要性,她指出,在基础研究领域要创造一个潜心研究的环境,并认为在深圳这个环境里,华大一定会很好地成长;在生物育种展区,农业和生命能源事业部负责人张耕耘详细介绍了植物育种示范项目-谷子和水稻育种、动物平台、海洋生物平台及现代育种新思路;在人才与教育展区,华大科学体系负责人李英睿详细介绍了华大创新人才培养模式、生物基础学科在教育普及的重要性及华大在此方面所取得的成绩,国务委员刘延东连声称赞,并和李英睿亲切握手并合影。 参观结束后,国务委员刘延东特别指出,此次参观调研时间虽短,但是印象深刻。在如此短的时间内,在广东,特别是深圳的支持下,经过各方面的努力,华大取得了非常大的成果,基因测序能力取得国际前沿地位,得到了国际的认可。其次,华大具有创新理念,特别是通过服务于国家的经济社会发展的目标,确定任务,来带动研究、产业、服务。国务委员刘延东肯定了华大的创新发展模式,她认为,在这个领域,二十一世纪生物技术和生物产业将来是一个最有前景的一个新兴产业,强调了从事生物职业的光荣,科学探索道路的艰辛,并指出,下一步将深化科技体制改革,加快国家总体建设,为华大的发展创造更好的条件。2011-08-24 00:00:00.0
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国家商务部投资促进局副局长张迎新赞扬华大做人类幸福工程
2011年8月19日上午,国家商务部投资促进局副局长张迎新一行来访华大,华大基因研究院院长汪建、副理事长龙岳华、助理总裁麦敏烽、农业和生命能源事业部负责人张耕耘、美洲华大负责人徐讯、欧洲华大负责人李宁、亚太华大负责人梁鸿生、老挝华大负责人李友谊等热情接待了来宾。 美洲华大负责人首先为来宾介绍了华大的发展历程、取得的科研成就,以及在产业应用中的进展,包括轻木及杂交谷子成果展示、垃圾分类循环经济工程、无创产前筛查、临床检测等医学健康项目。在华大新展厅,来宾不时赞叹,称华大正在进行的健康项目为“人类幸福工程”。 在双方的座谈会上,华大片区负责人分别介绍了华大在欧洲和亚太地区的发展现状及重点合作项目。并表示将于9月份与匈牙利签订战略合作协议,进一步开拓国际化发展的道路。张迎新副局长对华大的发展模式表示高度认同,并称赞华大利用领先前沿的高科技技术造福人类。双方就如何“走出去”的发展模式进行了更深入的讨论。2011-08-19 00:00:00.0
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澳门访问团应邀来华大寻求科研合作契机 促进相关健康项目在澳开展
2011年8月18日上午,澳门利镁投资集团总裁及澳门中医药产业协会会长刘宏裕、凯澳策略投资有限公司董事总经理及安徽省政协委员何敬麟、利镁投资集团董事总经理司徒作存等澳门代表团一行来访华大,华大基因研究院院长汪建、科技合作事业部及华南区第一负责人尹烨、华南区第二负责人彭智宇等热情接待了来宾。 参观中,彭智宇为澳门访问团一行详细介绍了华大的发展历程与科研成就,特别是华大在产业发明、人才培养、科研技术等方面取得的重大成果。此前,澳门方面曾派代表前来参观访问,此次来访,进一步加强了其对华大基因近期科研方向、产业发展以及人才培养等情况的了解。 会谈中,汪建院长表示,希望双方能在健康项目上密切配合,以将澳门打造成世界第一长寿地区为目标,打造“幸福澳门”,并在澳门人群基因组群体测序、无创产前基因检测、HPV、地贫等疾病检测等方面进行全方位合作。 澳门访问团一行认为,希望借助华大的尖端科研平台和先进技术,推动现代医疗健康应用在澳门的发展,同时诚邀汪建院长带队回访,推进华大基因相关健康项目在澳门的开展。2011-08-19 00:00:00.0
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华中科技大学同济医学院附属梨园医院与华大共谋全面合作
2011年8月16日下午,华中科技大学同济医学院附属梨园医院院长黄畦来访华大,华大基因研究院院长汪建、执行总裁王俊、华中/西区负责人牟峰、生育健康中心负责人王威等热情接待了来宾。 在华中/西区负责人牟峰的陪同下,来宾参观了华大新展厅,详细了解了华大科学发展新篇章、社会责任与民生篇、人才与教育篇、产学研资联盟创新篇及展望篇,并参观了华大分子育种与健康等实验室,重点了解了华大在医学健康等领域的研究成果,临床应用等情况。 随后,双方举行了座谈。黄畦院长首先介绍了梨园医院的整体情况,他说,现在老龄化程度很快,研究老年病意义重大,梨园医院有很好的样本资源,在人文环境、政策环境、交通、历史背景等方面都有很好的优势,希望结合华大的技术优势,差异化发展,开展全面合作。汪建院长认为,从诊断、治疗到预测、预防、预警、个性化治疗,对应现代社会人口老龄化重大疾病新的技术路线的试点,这种新的技术路线代表未来发展趋势。 随后,双方就合作的方向与目标以及详细规划作进一步讨论。2011-08-19 00:00:00.0
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澳门访问团来访华大参观与座谈
2011年8月18日上午,澳门利镁投资集团总裁及澳门中医药产业协会会长刘宏裕、凯澳策略投资有限公司董事总经理及安徽省政协委员何敬麟、利镁投资集团董事总经理司徒作存等澳门代表团一行来访华大,华大基因研究院院长汪建、科技合作事业部及华南区第一负责人尹烨、华南区第二负责人彭智宇等热情接待了来宾。 参观中,彭智宇为澳门访问团一行详细介绍了华大的发展历程与科研成就,特别是华大在产业发明、人才培养、科研技术等方面取得的重大成果。此前,澳门方面曾派代表前来参观访问,此次来访,进一步加强了其对华大基因近期科研方向、产业发展以及人才培养等情况的了解。 会谈中,汪建院长表示,希望双方能在健康项目上密切配合,以将澳门打造成世界第一长寿地区为目标,打造“幸福澳门”,并在澳门人群基因组群体测序、无创产前基因检测、HPV、地贫等疾病检测等方面进行全方位合作。 澳门访问团一行认为,希望借助华大的尖端科研平台和先进技术,推动现代医疗健康应用在澳门的发展,同时诚邀汪建院长带队回访,推进华大基因相关健康项目在澳门的开展。2011-08-18 00:00:00.0