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河南省登封市市委书记郑福林一行来访华大 共商合作
2014年6月6日上午,河南省登封市市委书记郑福林率李金勇副书记、统战部部长杨洁和科工信委任永立主任等一行7人来访华大。华大基因董事长汪建、华大基因基地建设负责人李友谊、华大方舟副总经理杨文献、植物育种产品孵化负责人邹洪峰予以热情接待。 河南省登封市市委书记郑福林一行参观了华大基因展厅,对华大基因的科研成果、产业应用、人才培养、发展模式等作了详细了解。郑福林书记一行对农业育种和养殖兴趣浓厚并就该问题进行了深入了解。 座谈会上,汪建董事长提出,登封市应依托现有资源优势实现“健康登封”产业升级。李金勇书记对“健康登封”这一提法非常赞同,双方就此进行了深入探讨。汪建董事长表示,华大基因愿意做好登封的技术支撑,同时将最前沿的科技、最立竿见影的效果和最可持续发展的项目带入登封。最后,李金勇书记邀请汪建董事长六月份到访登封市。2014-06-07 00:00:00.0
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广东省引进创新团队评委一行来访华大
2014年6月5日下午,广东省引进创新团队评委一行来访华大,对华大基因国际肿瘤基因组研究项目进行中期考核实地评审,陪同此次评审的还有省科技厅、专项办公室等相关领导。华大基因主席杨焕明院士、深圳华大基因研究院副院长张秀清、华大基因首席科学家刘斯奇、华大医学运营管理团队专职成员林梁、科学技术体系生育健康项目负责人蒋慧、华大基因倪鸣博士等予以热情接待。 广东省引进创新团队评委一行参观了华大基因各平台实验室,在华大基因展厅,来宾对华大基因的科研成果、产业应用、人才培养、发展模式等作了详细了解。 座谈会上,杨焕明院士就国际肿瘤基因组研究项目进展及取得成果情况进行了汇报。随后,蒋慧、倪鸣、刘斯奇分别就胃癌、前列腺癌、膀胱癌基因组研究情况进行汇报。汇报结束后,双方就项目相关问题进行了进一步的探讨。2014-06-06 00:00:00.0
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杭州市西湖区副区长陈玮、淳安县副县长郭东晓等一行来访 共商合作
2014年6月5日下午,杭州市西湖区副区长陈玮、淳安县副县长郭东晓等一行来访华大基因。华大基因董事长汪建、华东片区负责人杨晓楠、华大医学执行副总裁王学刚等予以热情接待。 在杨晓楠博士的带领下,来宾参观了华大基因展厅,了解了华大基因在科学技术、产业化发展、民生服务、教育与人才等方面取得的成果,并了解了华大基因在全球的产业布局。 在随后的座谈中,双方就杭州旅游城市升级生态健康城市可开展的相关合作进行深入交流。 座谈结束后,来宾一行参观了华大基因各实验室平台。2014-06-06 00:00:00.0
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绵羊基因组研究揭示瘤胃进化和羊毛生成脂类代谢遗传学机制——最新研究成果于《科学》杂志发表
2014年6月6日,中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等多家单位联合完成了高质量的绵羊基因组和转录组序列图谱,揭示了反刍动物瘤胃进化以及羊毛脂类代谢相关遗传学机制,为推动绵羊重要经济性状关联基因的鉴定研究奠定了遗传基础,从而加速专门化羊肉新品种的选育以及提高羊毛产量及质量的研究进程。最新研究成果今日于《科学》(Science)杂志在线发表。 绵羊(Ovis aries)是羊肉、奶类、羊毛的重要来源,与我们的日常生活息息相关,具有重要的经济价值。2013年我国国内饲养了约三亿只绵羊和山羊,并且进口了25.9万吨羊肉,这已经占世界羊肉总贸易的20%,而且中国羊肉市场的需求和价格还在持续增长。羊毛是绵羊的另一个显著特征,俗称“软黄金”,可见其经济价值非同寻常,在羊毛中很大一部分的比重是由蜡脂形成的羊毛脂。此外,绵羊也是反刍动物的典型代表,反刍动物是目前主要的陆生食草动物,具有瘤胃这一特殊消耗器官,它主要负责植物纤维的发酵。 在本研究中,科研人员完成了2只特塞尔绵羊的全基因测序工作,并对94个样本(采取自40种不同组织)进行转录组测序。最终科研人员获得25197个注释基因,其中20921个是蛋白编码基因。此外,他们通过对绵羊、山羊、牛、牦牛、猪、骆驼、马、狗、鼠、负鼠以及人的蛋白序列进行比对,在这11种基因组序列之间发现了4,850个单拷贝的同源基因。研究人员发现绵羊从山羊的分化时间以及牛科动物的多样化分化时间恰好与新第三纪后期草地的扩张处在同一时期,那一时期气温比现在要低很多,二氧化碳含量也比现在的大气中的含量高。 哺乳动物的表皮发育复合体(EDC)区域负责编码参与角质化组织表皮结构发育(如瘤胃、皮肤和毛发)相关的蛋白。研究人员在绵羊的EDC区域中首次鉴别到两种在反刍动物中发生特异蛋白结构改变,且仅在瘤胃中特异高表达的结构蛋白。其中一个是毛透明蛋白类似蛋白(TCHHL2),此蛋白是在皮肤中高表达的毛透明蛋白(TCHH)的同系物。另一个是小脯氨酸丰富蛋白II家族(PRD-SPRRII)。这两个结构蛋白发挥瘤胃表面基板的作用,通过转谷氨酰胺酶介导交联瘤胃表达的角蛋白,从而构成瘤胃壁粘膜层的坚韧的角质化表面,参与瘤胃表层角蛋白角质化形成。 绵羊是反刍动物的一个典型代表动物,绵羊具有四个胃室,其中瘤胃容积最大,并且瘤胃中的微生物菌群有助于植物食物中的主要成分木质纤维素的发酵。瘤胃中的微生物菌群也能够产生挥发性的脂肪酸,这个过程需要借助于反刍类特殊的能量和脂类代谢通路。与非反刍动物相比,反刍动物的肝脏主要以挥发性脂肪酸为碳源进行糖异生,而不是脂肪合成的主要场所。 皮肤和羊毛的主要作用是在绵羊和外部环境之间形成一个天然屏障,减少体内水份和热量的散失,并阻止外部病原体进入。羊毛脂占据羊毛重量的10%-25%,它是由羊毛毛囊的皮脂腺分泌的。研究人员发现除了肝脏,反刍动物的皮肤也是重要的脂类代谢器官。绵羊皮肤的转录组数据表明MOGAT2和MOGAT3发生了高表达,这两个基因是甘油酯o-酰基转移酶(DGAT2/MOGAT)基因家族的成员,主要参与甘油二酯(DAG)和三酰甘油(TAG)的合成。在已知的几乎所有哺乳动物中,MOGAT2和MOGAT3是单拷贝基因,然而在反刍动物中,这两个基因发生了串联基因扩增,表明了其正在进化新的功能。 绵羊皮肤中MOGAT2和MOGAT3蛋白的出现表明甘油二酯合成代谢通路发生了明显的改变。另外,MOGAT代谢通路也绕过了1-酰基-溶血磷脂酸(LPA)和磷脂酸(PA)合成步骤。皮肤生成脂肪酶((LIPH)使PA转化成2-酰基LPA,从而控制毛囊的成长。在一些哺乳动物中LIPH突变导致了类似于羊毛的毛发的生长。因此,绵羊皮肤中MOGAT代谢通路降低了甘油三酯合成和磷脂酸合成,皮肤屏障脂质合成和囊泡发育调控的耦合,有利于羊毛的生长。 华大基因该项目负责人谢敏表示,“绵羊是具有很高经济价值的饲养动物,它供给人们羊肉、羊奶和精细的羊毛。绵羊参考基因组序列为我们研究瘤胃进化和绵羊皮肤脂质代谢提供了遗传基础。应用基因组组装结果,我们能够进行许多绵羊相关的研究并且更加全面的了解这一物种,也更加有利于重要经济性状如羊毛、羊肉、羊奶相关基因标志物的筛选。”2014-06-06 00:00:00.0
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广州市番禺区卫生局罗文贤局长等领导一行来访广州华大
2014年6月4日上午,广州市番禺区卫生局罗文贤局长、王敏之党委书记、田晓学副局长等领导一行莅临广州华大。华大基因华南片区负责人彭智宇、华大基因助理总裁殷波、深圳临检中心主任兼华大医学产品总监张晓平等予以热情接待。 罗文贤局长一行参观了华大基因展厅、广州临检所实验室,了解了华大基因的发展历程、科研成果、产业应用、人才培养、社会责任等相关情况,同时详细了解华大的产业化应用、人才培养等并作了高度的赞扬。 座谈中,张晓平主任首先简述华大基因目前相关情况。随后,殷波向罗文贤局长汇报番禺大数据云健康整体建设方案,征求了卫生局领导们的意见。彭智宇作了会后总结,同时表达了华大基因希望以基因科技造福民生的信心及决心。 罗文贤局长表示,将会配合广州市政府、广州市番禺区政府加速推进与华大基因的合作,早日实现基因组学造福于人类健康的目标。2014-06-05 00:00:00.0
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我国代表参加2014年ISO生物技术委员会(ISO/TC276)年会
文章来源:国际合作部 由国际标准化组织/生物技术委员会(ISO/TC276)主办、德国标准化学会(DIN)承办的2014年ISO/TC276年会和各工作组会议于2014年5月14日至16日在德国柏林召开。来自中国食品发酵工业研究院、深圳市标准技术研究院、深圳华大基因研究院等单位的代表组成中国代表团参加了此次会议。 会议上,中国代表团就生物基因技术、生物样本和生物信息等标准提案同与会专家进行了深入探讨,得到了来自美国、英国、法国、韩国和日本的大力支持,为上述领域进一步开展工作奠定了基础。此外,经中国代表团邀请,ISO/TC 276决定在中国举办下一届全体大会,这不仅为我国生物领域企业实质性参与国际标准化活动提供了宝贵机会,让更多我国的科研成果与国际共享,还有助于促进国际标准化合作,推动我国生物领域国际标准化工作更快更好发展。 国际标准化组织介绍 国际标准化组织(即ISO,其全称是International Organization for Standards)成立于1947年2月23日,制作全世界工商业国际标准的各国国家标准机构代表的国际标准建立机构,总部设于瑞士日内瓦,成员包括162个会员国。国际标准化组织是一个全球性的非政府组织,是国际标准化领域中一个十分重要的组织。参加者包括各会员国的国家标准机构和主要公司。 国际标准化组织的任务是促进全球范围内的标准化及其有关活动,以利于国际间产品与服务的交流,以及在知识、科学、技术和经济活动中发展国际间的相互合作。它显示了强大的生命力,吸引了越来越多的国家参与其活动。 其宗旨是在世界范围内促进标准化工作的发展,以利于国际物资交流和互助,并扩大知识、科学、技术和经济方面的合作。其主要任务是:制定国际标准,协调世界范围内的标准化工作,与其他国际性组织合作研究有关标准化问题。 相关链接:我国代表参加2014年ISO生物技术委员会(ISO/TC276)年会2014-06-05 00:00:00.0
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华大科技获得美国FDA 21 CFR Part 11合格证书
2014年6月4日,深圳华大基因科技服务有限公司(以下简称“华大科技”)的产品质量信息管理系统——BMS系统,经UL(优力标准技术服务有限公司 UL Standard and Technology Service Company Limited)评估和验证,符合美国FDA 21 CFR Part 11(联邦法规21章第11款)的标准要求,华大科技深圳总部、武汉华大生产中心、香港华大生产中心分别获得美国FDA 21 CFR Part 11合格证书。 华大科技BMS系统主要用于记录和监测产品的生产、服务和质量管理全过程,目前该系统的使用完全遵循美国FDA 21 CFR Part 11(美国联邦管理法规21章第11部分)关于存储和保护电子结果以及应用电子签名的相关法规规定。华大科技BMS系统有效保证了华大科技的产品服务全过程中电子数据的有效性、可靠性以及电子签名应用的规范性。 U.S FDA 21CFR Part 11证书(深圳) U.S FDA 21CFR Part 11证书(武汉) U.S FDA 21CFR Part 11证书(香港)2014-06-04 00:00:00.0
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3000株水稻基因组序列于世界饥饿日公开发布
-由中国农业科学院、国际水稻研究所、华大基因联合开展的“3000株水稻基因组项目”将为全球研究人员提供海量的水稻基因序列资源。 由华大基因和生物医学中心(Biomed Central)共同创办的GigaScience是一个开放获取且数据公开的大数据期刊。2014年5月28日,3000株水稻基因组测序文章在GigaScience正式发表,且整套水稻基因序列以可引用形式在该杂志的附属开放获取数据库GigaDB中公开。该项目产生的数据是目前已公开水稻序列数据量的四倍。在“世界饥饿日”这天发布并公开这庞大的数据集,是为了体现该项目的最主要目标之一,为改善全球尤其是最穷困地区的粮食安全提供资源。该成果标志着3000株水稻基因组项目第一阶段的完成,主要由中国农业科学院(CAAS)、国际水稻研究所(IRRI)以及华大基因(BGI)合作开展,并获得了比尔及梅琳达·盖茨基金会和中国科技部的资金支持。 全球超过1/8的人口生活在极度饥饿和贫穷中,并且世界总人口仍在与日俱增(预计2050年将突破96亿),这迫切需要我们去创造新资源来改善作物产量,减少农业活动对环境的影响,并且开发具备高产量、高营养价值、能够在干旱,病虫害,疾病或贫瘠土壤条件下生长的粮食作物。虽然2005年第一个高质量水稻基因组序列图谱的完成极大推动了水稻研究,然而在培育改良具有更好适应性的水稻品种等育种实践方面却成效甚微。 “3000株水稻基因组项目”所产出和公开的大量遗传信息将最终被应用到智能育种实践中,为解决这些挑战迈出了重要的一步。不同植株间存在自然变异,而了解这些不同性状发生的遗传机制,将有助于成功培育出可高度适应不同环境的杂交品种。 中国农业科学院项目负责人黎志康博士表示,3000株水稻基因组项目是目前正在为亚非地区贫困农民提供资源所进行努力的一部分,旨在造福生活在16个目标国家(8个非洲国家和8个亚洲国家)的2000多万水稻农户。“大部分亚洲人民以水稻为主食,并且非洲水稻消耗量逐年递增。”黎博士指出,“无论是现在还是将来,随着资源(水和土壤)锐减,粮食安全将是或已是这些国家所面临的最大挑战。作为水稻遗传学、育种和基因组学领域的一名科学家,助力解决这项问题无疑是我们的梦想。” 华大基因院长王俊博士补充道:“人口激增和愈演愈烈的环境危机已经让全球粮食短缺和安全面临巨大的挑战。华大基因致力于通过基因组学技术实现快速、可控、高效的分子育种模式。这为农业育种开辟了一条新道路。通过与中国农业科学院(CAAS)、国际水稻研究所(IRRI)和盖茨基金会的协作努力,我们已经向以大数据为基础的农业研究和数字化育种迈出了重要一步。我们深信所作出的每一步努力都将使我们离造福人类这一终极目标更近一步。” 国际水稻研究所总负责人Robert Zeigler博士表示:“3000株水稻基因组数据的公开将极大地增进育种计划的实力,以克服不久将来人类所面临的关键性障碍。”对于这个项目,Robert Zeigler博士又补充道:“这将为水稻遗传学补充大量的知识,使全球研究团体可以进行更详细的分析,从而最终使在最艰难的环境条件下种植水稻的穷苦农民获益。” 在GigaScience附带的评论中,王俊博士、Robert Zeigler博士以及中国农业科学院的李家洋博士提供了关于这个项目研究目标的进一步信息。 为了实现他们的目标,由三家研究所发起的合作不仅公开了13.4TB的数据资源,而且他们还收集了每株水稻的种子(存放于国际水稻研究所的水稻基因资源库中)。储存这些种子对充分利用这些遗传信息已知的水稻品种来开发和验证最适合不同环境的杂交株是十分必要的。然而,实现这一目标的另一条件是这一信息可以使研究人员和育种专家直接将遗传信息(基因型)和不同植株的性状特征(表型)联系起来。这需要仔细评估和管理每株水稻的重要农业性状特征,之后再在可用的基因组序列中与其相应的遗传标记相关联。 自农业发展以来,现代育种实践延续至今,通常依据表观性状特征来指导候选植株杂交,并期望杂交后代能够表现出结合和改良的预期性状,如抗旱、抗病虫、产量提高和营养价值增加。然而,当两个植株进行杂交后,对应的遗传组成常常使育种学家的期望落空,因为未知的基因相互作用会限制、修饰或改变所选择的性状特征的形成。因此,常常需要试验、发现错误和多个连续的育种阶段。 全面了解一个植物的遗传组成可以使研究人员鉴定与特定性状特征相关联的遗传标记,并且可以更好地了解不同的基因相互作用是如何影响植物的表型的。这些信息使育种专家在植株选育上更加明智,从而实现更加准确、快速的水稻品种培育,以适应经济贫困和自然条件压力下的不同农业环境。 这个过程需要投入大量的精力与人力。因此,这些向全球植物育种学家和科学家免费公开的数据,将极大地推动水稻的基因型/表型之间关联的研究,同时对加深植物生物学的理解提供了丰富的资源。 发表在GigaScience杂志上的内容还包括储存于GigaDB数据库中的相关数据。GigaDB数据库中的每个数据集都有一个数字对象标识符(DOI),可用于引用,检索和在标准的科学文献中追踪数据,它为研究人员提供了一个强有力的动机去更加快速地发布大量、密集型的数据集供科研团体使用。除了将数据公开于GigaDB数据库中之外,为了使科研人员最大程度的获取这些数据,3000株水稻基因组数据也同时提交到SRA数据库(PRJEB6180)。 相关阅读: 1.3000株水稻基因组文章(链接:http://dx.doi.org/10.1186/2047-217X-3-7) 2.王俊博士、Robert.Zeigler博士以及中国农业科学院的李家洋博士对“3000株水稻基因组项目”评论(链接:http://www.gigasciencejournal.com/content/3/1/8 ) 3.3000株水稻基因组数据(链接:http://dx.doi.org/10.5524/200001) 4.国际水稻资源库(链接:http://irri.org/our-work/research/genetic-diversity/international-rice-genebank ) 5.关于世界饥饿日(链接:http://www.thehungerproject.co.uk/getinvolved/worldhungerday/world-hunger-day-purpose/)2014-05-28 00:00:00.0
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华大医学获“现代生物基因教育社会实践基地”称号
2014年5月27日下午,深圳市盐田区中小学现代生物基因教育社会实践基地签约授牌仪式在深圳华大基因隆重举行。深圳市盐田区教育局授予华大医学“深圳市盐田区中小学现代生物基因教育社会实践基地”荣誉。盐田区教育局、盐田社工协会相关领导及嘉宾、盐田区13所中小学学生代表、华大医学代表以及来媒体记者一同出席本次活动。 授牌仪式上,盐田区教育局领导、盐田社工协会领导及华大医学签约代表作了精彩致辞。盐田教育局张光宏处长强调,“盐田区中小学现代生物基因教育社会实践基地”是在社会教育领域有突出贡献的企业单位,在全市有示范作用和推广价值的社会教育示范工程,在全市有重大影响的,且同生物基因有密切相关的生物科研机构。 华大基因临床检验中心有限公司总经理赵立见致辞中表示,华大医学被授予现代生物基因教育社会实践基地的荣誉,充分显示了盐田区教育局和社工协会对华大医学让基因科技贴近百姓生活的支持和肯定。今后,华大医学将继续通过此类系列科普、趣味性宣传活动,希望让更多的孩子了解基因及基因与健康的关系;也希望通过这种科普宣传,能激发更多孩子投身于生命科学领域,投入到国家产业建设中。 随后,深圳市盐田区教育局、深圳市盐田区社工服务中心、华大医学三方共同签署共建现代生物基因教育社会实践基地协议,盐田区教育局向华大医学授予“中小学现代生物基因教育社会实践基地”牌匾。华大医学成为深圳市唯一一家获得现代生物基因教育类社会实践基地称号的企业. 在现代生物基因教育社会实践基地建设工作中,华大医学充分利用在高通量测序、高灵敏度质谱、大数据等方面的优势,以实验室开放、科普讲座、展厅参观等多种形式,积极为在校学生提供现代生物基因学习和实践机会。“盐田区中小学现代生物基因教育社会实践基地”的设立,将更有利于盐田区培养中小学生的科学精神和创造能力,塑造青少年探求科学的意志品质,对于拓展素质教育新领域,普及现代生物基因知识,特别是提升广大青少年的科学素质,将发挥积极作用。 活动结束后,华大医学工作人员带领乐群小学、庚子首义中山纪念学校、盐港学校的学生代表参观了华大展厅、实验室。2014-05-28 00:00:00.0