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安捷伦代表来访 寻进一步合作
2011年12月5日,安捷伦科技有限公司(Agilgent Technologies)生命科学集团总裁尼可拉斯▪罗拉夫斯博士一行三人来访华大基因。 来宾受邀参观了华大基因展厅、农能平台、测序仪实验室以及质谱平台,深入了解了华大基因的发展概况以及现状。随后来宾一行与华大基因院长汪建进行座谈,寻求进一步合作。华大基因助理总裁李京湘、采装与质控部第一负责人李黎出席了座谈。2011-12-05 00:00:00.0
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肾透明细胞癌基因组学研究成果于《自然-遗传学》杂志发表——为肾癌诊断、治疗提供新思路
2011年12月5日,由华大基因、北京大学深圳医院和深圳市第二人民医院等单位合作完成的研究成果——《对肾透明细胞癌中泛素介导的蛋白降解通路的相关基因突变研究》(Frequent mutations of genes encoding ubiquitin-mediated proteolysis pathway components in clear cell renal cell carcinoma)在国际权威杂志《自然-遗传学》(Nature Genetics)上在线发表。这是继今年八月份在《自然-遗传学》上发表的膀胱癌研究之后,该团队取得的又一重要癌症研究成果,为肾癌的发病机理研究以及诊断、治疗奠定了坚实的科研基础。 肾癌是泌尿系统肿瘤中致死率最高的一种,其发病率和死亡率约占全部肿瘤的2%。其中,肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是肾癌中最常见、恶性程度最高的一种亚型,每年全世界大约会有102,000例患者因此而死亡。 在本研究中,研究人员对10例ccRCCs患者的肿瘤组织和正常对照样本进行了外显子测序研究,并在88例ccRCCs患者中进行了验证,鉴定出23个与ccRCCs相关的显著突变基因,其中12个基因是首次在ccRCCs中被发现。 泛素介导的蛋白降解通路(Ubiquitin-Mediated Proteolysis Pathway, UMPP)是调节多种细胞生物学过程的重要机制,在正常细胞的蛋白质降解中起着十分重要的作用。在本研究中,研究人员对所有的含有非同义突变的基因进行信号通路分析,结果发现UMPP相关基因突变频率较高,约有50%的检测样本的UMPP相关基因发生了突变,包括VHL(27%),BAP1(8%),CUL7(3%),BTRC(2%)等。已有研究发现,VHL基因(UMPP通路成员之一)为抑癌基因,该基因的失活可导致两个重要的缺氧诱导调节因子——HIF1α和HIF2α的累积,从而使肿瘤发展相关基因(VEGF, PDGF等)表达增加,这与ccRCCs的发生发展有着密切的关系。研究人员推测,与UMPP相关的其他基因的异常,也可能会导致类似的结果。 为了证明该推测,研究人员对所有的ccRCCs患者样本进行了免疫组化分析,发现UMPP通路异常和肿瘤组织中HIF1α、HIF2α的过量表达有着密切的关系。进一步研究发现UMPP通路中除VHL基因之外的其他基因突变和肿瘤组织中HIF2α的过量表达确实具有明显的正相关性,这表明非-VHL的UMPP基因在该过程中也可能发挥着重要的作用。 文章的第一作者、华大基因该项目负责人郭广武博士说:“通过此次研究,我们推测由UMPP相关基因突变而激活的缺氧调节网络与ccRCCs的发生有着非常重要的关联,但是HIF1α和HIF2α只是UMPP调控的整个蛋白网络的一员,今后我们会对ccRCC的蛋白质组进行研究,进一步探索UMPP在肾癌发生、发展中的作用。”2011-12-05 00:00:00.0
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成都市医院管理局一行到访华大 共签合作协议
2011年12月2日,四川省成都市医院管理局(以下简称“医管局”)副局长何杰等一行5人到访华大基因深圳总部,在华大基因医学健康事业部负责人易鑫、孵化体系首席科学家祁鸣等的陪同下,考察了华大在基因组学的临床科研、技术孵化和产业推广等方面的成果,并同华大协商签署了临床孵化合作的备忘录。 何副局长高度赞赏了华大基因在国内外取得的成绩、做出的巨大贡献、特别是华大基因致力于将基因组学应用于临床科研、造福人民的高度社会责任感与科学家的使命感,并对华大基因即将落户成都基地,并开展一系列科研合作与产业推广表达了期盼和展望。 考察结束后双方举行了“华大基因成都临床技术研究与孵化示范基地”合作签约仪式,华大基因研究院副总裁张秀清、医学健康事业部负责人易鑫、华大基因生育健康临床诊断及咨询主管、浙江大学医学院特聘教授祁鸣等出席了签约仪式。同时双方成立华大基因成都临床技术研究与孵化示范基地领导小组,成都市医院管理局副局长何杰与华大基因副总裁张秀清担任领导小组组长,华大基因孵化体系首席科学家祁鸣老师与成都市妇女儿童中心医院产前诊断分中心主任、主任医师、医学博士吕康模老师担任专家组组长。 未来双方将围绕地方性、多发、高危、早期筛查、预防监测等多个维度,结合基因组学在临床方向的诊断及预防优势,在临床应用项目及基础研究项目两大方向开展合作,建立华大基因成都临床技术研究与孵化示范基地,并对成熟的科研成果进行技术论证与价格申报,以推进双方产业发展。 根据华大基因孵化体系相关负责人介绍,此次示范基地的建立将为华大临床项目技术孵化与产业推广提供广阔的空间与丰富的资源,成为华大临床项目研发与推广的有力保障。同时,在医药卫生体制深度改革的背景下,在基因组学临床转化关键时期,这次的合作也是一次大胆的尝试与创新!华大基因与成都市医管局及其下辖医院合作后,将会对合作伙伴的基础研究与临床应用起到支持与推动作用,对合作伙伴的综合实力提升,技术创新与人才培养等诸多方面具有积极的意义,必将实现民生、科学、技术、产业多赢的局面。 成都市医院管理局背景介绍: 为适应医药卫生体制改革要求,根据《成都市深化医药卫生体制改革总体方案》精神,成都市医院管理局于2010年1月正式成立。医管局受市政府授权举办和管理市属公立医院、国有医院的机构,代表政府履行出资人职责,行使投融资决策权、资产处置权、院长选聘权,负责医院业绩考核和国有资产监督。医管局与卫生局分别履行国有医院出资人的承办职责与行业宏观管理职能,推进医疗机构的“管办分离”以实现“医疗需求方福利化、医疗提供方市场化”的目标,从而形成平等竞争、充满活力的医疗卫生体系。 医管局下辖12家市级公立医院。其中,其中三级综合医院5所,二级综合医院2所,专科医院5所;编制床位7000余张。现有职工10000余人,专业技术人员近8000人。2011-12-02 00:00:00.0
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中国科学院植物研究所和华大基因共同完成甜高粱基因组序列多态性分析——研究成果于《基因组-生物学》杂志发表
由中国科学院植物研究所、华大基因和新加坡淡马锡研究所共同完成的甜高粱基因组变异研究成果(Genome-wide patterns of genetic variation in sweet and grain sorghum (Sorghum bicolor))于2011年11月21日在国际著名杂志《基因组-生物学》(Genome-Biology)上在线发表(http://genomebiology.com/2011/12/11/R114/abstract)。该研究成果为深入挖掘甜高粱优良性状基因以及促进遗传育种改良等研究提供了非常有价值的参考。 高粱是世界上第五大禾谷类作物,在干旱、半干旱地区农业生产中占有极其重要的位置。甜高粱是高粱的一个自然变种,同普通籽实高粱相比有着诸多独特的生物学和农艺学性状,如高光合效率、大生物量和更强的耐逆性等。甜高粱还因高秸杆含糖量,成为我国和世界发展第1、2代生物质液体燃料的重要作物。2009年,美国能源部联合基因组研究所就已完成高粱的全基因组测序,使高粱成为继水稻之后第二个被测序的禾本科植物,但有关甜高粱和普通籽实高粱在基因组水平的差异尚未有深入研究。 在此次发表的成果中,研究人员利用新一代高通量测序技术,对2个甜高粱和1个中国籽实高粱品系进行了全基因组重测序及生物信息学分析。经与已知的籽实高粱基因组序列比较后,发现甜高粱和籽实高粱在近1,500个基因中存在序列和结构差异,这些基因的功能涉及糖与淀粉代谢、木质素和香豆素合成、核酸代谢、胁迫应答和DNA修复等活动。同时,研究人员还发现了1,057,018个单核苷酸序列多态性位点(SNPs),99,948个小片段(1-10bp)缺失(Indels),16,487个获得和缺失变异(PAVs)以及17,111个拷贝数变异(CNVs)。这些结果对研究人员下一步深入研究基因组变异如何影响生物学性状,建立基因与性状的关联分析以及开展高粱育种改良等方面的研究具有很大的帮助。 文章第一作者、华大基因该项目的负责人郭小森研究员说:“本次研究主要阐释了甜高粱和籽实高粱在基因组水平上的差异,之后我们将会进一步对这些差异进行深入研究,希望我们的工作能为揭示甜高粱重要的生物学特性奠定坚实的分子遗传学基础,并进一步对甜高粱的育种改良,以及为探寻更加优秀的生物能源来源起到积极的推动作用。”2011-12-02 00:00:00.0
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荷兰奈梅亨医学中心人类遗传学系Ad Geurts van Kessel教授来访 探讨未来合作
2011年11月29日,荷兰奈梅亨医学中心(Radboud University Nijmegen Medical Centre)人类遗传学系,肿瘤基因组学研究负责人Ad Geurts van Kessel教授和Roland P. Kuiper助理教授一行来访华大基因。华大基因院长汪建,欧洲华大负责人李宁,生育健康中心负责人王威,亚太区第一负责人梁鸿生及科学团队负责人李英睿等予以热情接待。 在随后举行的座谈会上,双方介绍了各自医学研究和应用的主要内容和方向,并就未来在临床研究、应用方面的合作内容与模式进行了深入地探讨。2011-11-30 00:00:00.0
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华大基因和NimbleGen联合研发出最新人类MHC区域捕获技术
2011年11月28日,华大基因和罗氏NimbleGen公司联合宣布已成功研发出全新人类MHC区域捕获技术,该技术突破了常规扩增和捕获方法的瓶颈,首次成功实现了对人类MHC区域的高度覆盖及有效富集。全新MHC捕获技术和新一代高通量技术的完美结合,将有助于科研人员从基因水平深入探究与MHC区域相关疾病的病因及遗传机制,对生物医药产业的发展具有极大的推动作用。 据了解,该技术捕获的区域不仅覆盖了传统的3.37Mb、MHC区域,并且还向上下游共扩展了约1.60Mb的区域,共计4.97Mb(chr6: 28477797-33448354),此外,该区域还包涵了目前已发现的MHC区域8个单体型信息。在覆盖度方面,该技术可覆盖高达97%以上的MHC区域,并且对mRNA区域更是实现了几乎100%的覆盖。在准确性方面,该技术检测的MHC区域的SNP位点与基因分型技术检测的SNP位点的一致率高达99.42%,并且还可挖掘到更多新的SNP信息。 主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC),在人类中又称为人类白细胞抗原系统 (Human Leukocyte Antigen,HLA),位于第6号染色体短臂上,该区域包含约150个可表达基因,其基因密度(37个/Mb)是全基因组平均基因密度(7个/Mb)的5倍,是人类基因组中最复杂的多态性区域。MHC区域广泛参与免疫应答的诱导与调节,激发机体特异性免疫反应,在免疫学上具有极为重要的意义。目前已发现包括自身免疫疾病、癌症、多种复杂疾病等至少百余种疾病均与此区域的多态性位点及变异相关。此外,该区域的多样性被认为与进化的多样性有关,加上其存在连锁不平衡和单体型遗传的现象,因此还常被用于群体进化、亲子鉴定和移植配型等研究。 华大基因研究人员蒋慧说:“我们与罗氏NimbleGen公司合作研发的全新MHC区域序列捕获技术,主要对探针设计和捕获流程进行了优化,极大地提高了对MHC区域的覆盖度和捕获效率。此外,该技术还加强了对pooling技术的优化,可实现多样品的有效捕获,极大的节约了研究成本。MHC捕获技术与新一代高通量测序技术的高效结合,必将为人类疾病及医药研发等相关领域带来更多新的发现。”2011-11-28 00:00:00.0
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汪建院长考察广州大学城 探讨生物健康产业发展新模式
2011年11月25日下午,深圳华大基因研究院院长汪建携华南区第一负责人尹烨、华南区第二负责人彭智宇等应邀前往广州市大学城访问考察。广州市番禺区区委书记卢一先、区长楼旭逵、副区长林伟长、广州大学城健康产业产学研孵化基地总经理金维刚等予以热情接待。 在楼旭逵区长主持下,华大访问团听取了广州大学城生物医药健康产业发展状况及广州大学城发展规划。针对番禺区提出的欢迎华大入户广州大学城的邀请,汪建院长表示,华大基因将坚持“产学研”一体化发展模式,充分利用广州得天独厚的医疗、教育资源,以降低出生缺陷、幸福华南、引领生物医药健康产业发展为目标,在广州设立华大基因华南区总部。随后,汪院长给全区领导作《基因引领未来》的专题报告。报告中,汪建院长提出“不跟鬼佬起哄”、“建立中国人的参考数据库”、“建立中国的国际标准样品库”、“发表里程碑式科研论文”、“建立全球标准、国际标准”等经验总结,引发在座听众的共鸣与深思。 随后华大访问团与广州市番禺区区委书记卢一先会面。卢一先书记对华大访问团一行的回访表示热烈欢迎,希望华大基因在番禺区设立华南区总部,共同为广州生物医药健康及教育产业发展做贡献。2011-11-27 00:00:00.0
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汪建院长出席2011CCTV中国经济年度人物深圳论坛
2011年11月26日下午,由中央电视台财经频道举办的2011CCTV中国经济年度人物深圳论坛在深圳香格里拉酒店隆重举行。本次论坛以“高新技术产业的新推动力”为主题,2010CCTV中国经济年度人物得主——华大基因研究院院长汪建出席了本次论坛。 本次论坛汇集了深圳领导、著名经济学家、往届年度人物、商界领袖等。深圳市委副书记、市长许勤、经济学家胡祖六、往届CCTV中国经济年度人物得主——华大基因研究院院长汪建、深圳市创新投资集团有限公司董事长靳海涛、广东明阳风电产业集团总裁张传卫等齐聚中国第一个经济特区——深圳,以领军者的智慧解析中国经济,寻找全球变革中的可持续动力。 据了解,CCTV中国经济年度人物评选历经十一年光荣与梦想,共评选出110多位中国经济年度人物,这些年度人物在中国经济的舞台上已经成为了动力之源和活力之源。 论坛围绕深圳发展高新技术产业的最大优势、中国制造是否正在遭受严冬、中国高新技术产业的突破点、中国是否会诞生自己的苹果公司等相关中国经济热点问题展开讨论。 本节目将于2011年12月7日23:10在中央电视台二套财经频道播出,敬请关注。2011-11-27 00:00:00.0
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汪建院长率团应邀赴川渝考察访问 全面开启华大华西战略布局
2011年11月20日至24日,华大基因研究院院长汪建应重庆市政府、四川省科技厅等政府及院校之邀,率华大基因华西区负责人牟峰、华大生育健康中心负责人王威、重庆华大筹建负责人曹洋考察走访重庆、成都等地,全面开启华大基因华西区的战略布局。 11月21日上午,在重庆市副市长吴刚组织协调下,汪建院长一行会见了重庆市发改委副主任罗清泉、重庆市科学技术研究院副院长皮晓青及发改委、研究院相关部门的领导专家,双方就运用华大基因世界领先的基因测序和生物信息分析能力为提升重庆科技实力、带动重庆新兴技术产业、推动重庆公共健康、发展重庆医疗卫生事业进行了深入探讨。 11月24日上午,在四川省科技厅副厅长周孟林、副厅长陈放的组织安排下,汪建院长一行与四川省相关职能部门领导、农林医药等相关领域专家就华大基因在川发展进行了会谈。汪建院长表示华大基因将结合四川省丰富的物种及医学资源,为四川省的生命科学发展提供全新、一流的科学技术平台,推动四川省的科研及产业发展,提升当地的医疗水平,造福人民百姓。 考察期间,汪建院长分别在重庆医科大学、中国人民解放军第三军医大学、四川大学举行了大型专题演讲会,并与重庆医科大学校长雷寒、副校长黄爱龙、副校长杨竹,第三军医大学校长罗长坤,四川大学生命科学学院肖智雄院长、副院长林宏辉等高校领导专家进行亲切座谈,就科研合作、人才培养进行了深入探讨并达成意向性协议。此外,汪建院长一行应邀到访重庆医科大学儿童医院、华西妇女儿童医院进行座谈交流,并与两家医院达成初步合作意向。华大基因将联手重庆医科大学附属儿童医院、华西妇产儿童医院,以研究相对简单的单基因遗传代谢性疾病为切入点,优化利用医院临床资源、专业知识优势和华大基因生物基因组学科研实力,与欧美一流研究机构开展合作,在中国寻找相应病例进行深入研究,共同发表科研论文、快速确立国际标杆地位,并逐渐建立完善临床标准。2011-11-26 00:00:00.0