2007年3月16日，研究院在深圳市科技和信息局登记备案，获得科技类民办非企业登记注册资质。名称最终核准为：“深圳华大基因研究院”。深圳华大基因研究院正式成立。2008年6月，深圳华大基因研究院变更为事业单位。