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2008国际基因组学大会将于11月在深圳和香港举行
2008年国际基因组学大会将于2008年11月2日至11月5日在中国香港和深圳举行。本次大会由深圳市政府和香港特区政府联合主办,深圳华大基因研究院,香港科技园联合承办。此次大会旨在探讨基因组学研究的新方法以及在亚太地区的应用。促进内地、香港、亚太地区相关领域的科学家和企业界人士之间的交流,为了解基因组学领域的最新学术进展、新技术、新服务提供崭新的平台。整个会议包括:基因组技术,应用基因组学-生命之树篇,应用基因组学-基因与健康篇三大议题。届时将邀请来自全国各地的在本领域有影响力的专家学者作报告。热忱欢迎国内外从事基因组学、医疗和健康产业的有识之士踊跃参加! 请有意参会者提前办理港澳通行证。2008-08-22 00:00:00.0
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深圳市市委常委、常务副市长许勤来华大视察
2008年8月20日上午,市委常委、常务副市长许勤率市发改局、规划局、科技信息局、人事局、国土房产局、环保局、知识产权局等部门负责人等二十多人一行到我深圳华大基因研究院视察。盐田区区长袁宝成,区委常委、常务副区长龙岳华,区委常委、区委(区政府)办公室主任梁景海及区有关部门负责人十多人陪同视察。 许勤一行对深圳华大基因研究院测序技术平台,生物信息平台和克隆平台,以及华大基因基因健康事业部及低碳经济中心等进行了视察并详细听取了各平台和部门负责人的介绍。随后,华大基因总裁汪建向市、区领导作了汇报。许勤在听取汇报后表示,此行对华大基因所从事的工作和研究有了更进一步的了解,对华大基因所展现出的扎实的科研工作作风和所做出的成绩表示赞赏;生物产业是深圳市未来的重要产业体系之一;我们要对生物产业的发展充满信心,相信在包括中国在内的世界大多数国家将生物产业将作为继信息产业之后又一个引领人类科技变革和经济发展的产业共识的大背景下,华大基因只要坚持努力,就可以在未来的道路上创造更大的辉煌;此外,许勤副市长指出华大在老挝开展的生物能源开发也对深圳如何开展这一产业的研究和生产提供了新的创新模式。2008-08-20 00:00:00.0
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自主超算集群技术助力前沿基因组科学研究
该集群针对基因组学海量数据特点,尤其是应对新一代测序技术的高通量数据产出需求,全面采用新一代Intel至强4核处理器和开源的64位Linux操作系统,配合华大自主开发的面向新一代测序技术的管理和计算软件搭建而成。“有数据才是硬道理”,这是华大基因在基因组科学研究能够跻身世界前列的重要成功因素。该集群目前每天能处理6T的基因组数据,相当于每天能存储、分析3个人的基因组数据。在追求计算更快,处理更高通量的数据的同时,深圳华大基因研究院还和Intel合作,打造更加绿色节能的高性能计算机,目前每万亿次的功耗仅为8千瓦,比以前的大型计算设备降低了近10倍。在测试完Intel在中国仅有的6片新一代45nm低功耗CPU中的两片后,深圳华大更有信心在绿色节能的高性能计算上有所突破。 该超级计算机集群已经出色地完成了炎黄1号的数据处理和分析的任务,为破解黄种人基因组,提高黄种人的健康水平起了重要的作用。目前,该集群不仅正在处理炎黄99的数据,同时还承担起大量国际合作科研项目的数据处理和计算任务,其中包括国际合作千人基因组项目,大熊猫基因组项目,生命之树项目和欧盟MetaHit肠道元基因组项目等。早在2005年,华大基因就开始了生物信息高性能计算集群的研究,项目被命名为BLC(Bioinformatics Linux Cluster,即生物信息Linux集群)。2007年初,深圳华大基因研究院一落户深圳盐田就启动炎黄1号项目的研究,为了保证项目的顺利进行,开始了一期的超级计算机集群的建设,设备6月中投入使用,计算峰值就达1.5万亿次每秒,存储达100T。9月初,随着炎黄项目进入最后的攻坚阶段,计算和存储能力告急。9月中旬二期设备一到位就开始投入使用,计算峰值提高到4.5万亿次每秒,存储规模达到300T。今年4月,熊猫基因组和国际千人基因组项目的启动,深圳华大基因研究院的计算和存储再次告急,7月初三期超算建设完成并正式投入使用,计算峰值达8万亿次,存储670T。 今年年底,随着生命之树项目和欧盟MetaHit等国际合作项目的启动,届时需要一套计算峰值达20万亿次每秒,存储规模达1P的超级计算机集群,继续为世界前沿基因组科学研究“计算到底”。2008-07-19 00:00:00.0
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科技部抗震救灾应急分析病原微生物检测组开始取样和初步检测工作
5月30号,科技部抗震救灾应急分析病原微生物检测组到绵竹遵道镇进行取样和初步检测; 5月31号,都江堰取样;2008-06-02 00:00:00.0
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华大基因赴灾区希望将烈性和重要传染病的快速检测和检测体系应用到地震灾区的灾后疾控
华大基因与中科院北京基因组研究所应用医学基因组研究室的汪建与陈唯军在18日晨的6级余震中到达四川灾区,为建立应对灾后烈性和重要传染病的快速监测和检测体系、应对可能的突发公共卫生事件而出谋划策,贡献集体的力量与智慧。目前灾区已经进入到卫生防疫攻坚阶段,及时启动应对灾后烈性和重要传染病的快速监测和检测,设立实验室对灾区进行传染性疾病的监测,并为应对可能的突发公共卫生事件具有重要的意义。作为国家突发公共卫生事件病原微生物应急实验室网络的组成成员,在此紧急关头,我们希望能为灾区的卫生防疫工作尽一份心、出一份力,做一份贡献。 华大基因与北京基因组研究所共同参与了包括SARS、高致病行性禽流感及海啸救援等突发事件的处理,承担了国家生物安全的重大项目,已备有多种重要烈性传染病和常见传染病的诊断试剂及相关仪器,是一支久经考验、能打硬战的队伍,也是北京奥运会的生物安全应急网络实验室的成员。我们希望在国家CDC及四川省CDC的领导下,应用最先进的技术方法,协助灾区卫生防疫部门,为做好传染性疾病的监测工作做些贡献。 我们已将我们的技术方案、相关试剂、仪器及建议报给四川省CDC的有关领导和部门,并提供渠道将此建议报告给了卫生部和国家CDC的灾区前线负责人。大家充分肯定了我们技术方案的全面和先进性,正在报请有关领导批示。 在盐田区委区政府的指导和支持下,华大基因希望将烈性和重要传染病的快速监测和检测体系应用到地震灾区的灾后疾控中。华大基因北京和深圳实验室工作人员将处于时刻出发的待命状态。 深圳华大基因研究院将与万科企业集团密切配合,为重建灾区的一个小镇(8千户规模)而共同努力。万科将帮助重建小镇,华大将负责小镇的健康和卫生等重建事宜。万科与华大的主要负责人将于20日共聚灾区,决定相关事宜。 深圳华大基因研究院还将与北京苹果基金会密切合作,开展为灾区人民送医送药的活动。苹果基金会动用上百万的善款,购买了灾区急需的样品和器材,将于20日运抵成都,华大作为其合作者,将参与相关救援工作。 华大基因地震灾后疾控工作组 2008年5月19日2008-05-19 00:00:00.0
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深圳华大基因研究院及中科院北京基因组研究所应用医学组赴四川地震灾区救援队活动纪实
2008年5月18日,地震发生后的 6天,灾区大量尸体发生腐烂,重大传染病、突发公共卫生事件随时可能发生。受盐田区委、区政府的委托,华大组成赴地震灾区救援队,主要任务是监测可能的突发卫生和传染病事件。华大在应对突发疫情方面具有较丰富的经验,并备有应对烈性传染病及未知传染病的监测和检测配套技术,在必要时可以发挥特殊作用,成为现有消毒灭杀和疾病预防的重要补充。当日汪建由深圳,陈唯军由北京出发,午夜汇聚成都。当晚受到了第一场6.4级余震的迎接。 5月19日上午,汪建和陈唯军来到四川省CDC应急办,见到了CDC应急办和CDC微生物所的主要负责人,介绍了华大基因与北京基因组研究所曾共同参与了包括SARS、高致病性禽流感及海啸救援等突发事件的应对工作,承担了国家生物安全的重大项目,已备有主要的烈性传染病和常见传染病的诊断试剂及相关仪器,是一支久经考验、能打硬战的队伍,也是北京奥运会的生物安全应急网络实验室的成员。我们将技术方案、相关试剂、仪器及建议报给四川省CDC的有关领导和部门,希望在国家CDC及四川省CDC的领导下,应用最先进的技术方法,协助灾区卫生防疫部门,为做好传染性疾病的监测工作做些贡献。 我们还与卫生部和国家CDC的灾区前线负责人取得了联系,大家充分肯定了我们技术方案的全面和先进性,认为我们的烈性和重要传染病的快速监测和检测体系是现有防疫工作的重要补充,未来可能需要,让我们随时待命。 19日下午,汪建陪同军事医学科学院院长孙健忠将军、科技部副部长许天昊等四人,在四川山友救灾负责人李新帮助下驾车奔赴这次地震的中心——汶川县映秀镇,百余公里的路程经过了近6个小时的艰苦跋涉,一路上遇危路、断桥、滚石、和随时可发生的泥石流等艰险,平均不到一公里就看到一辆被滚石和泥石流砸毁和埋掩的汽车,令人触目惊心,午夜时分到达映秀镇。 20日,总后勤部孙大发上将来映秀镇视察部队。汪建与军事医学科学院孙健忠将军及前线防疫总指挥院科技部王玉民将军讨论了华大参与重大传染病的主动监测与预防的可能性,得到了积极肯定,欢迎我们适时加入。 20日汪建还拜见了广东省医疗救援队总指挥卫生厅副厅长廖新波及深圳医疗队队长周汉星医生,并进行了医救与防疫的交流。因大型车不能进入,生活物资补给缺乏,驻扎在那里的深圳医疗队缺少大型帐篷,后经与军方协调,调拨了两顶军用大帐篷解决了他们的燃眉之急;还与现场法医交换了遗体鉴定的经验;体验了现场挖掘、医疗救护、卫生防疫的艰辛,见证了地震中心地动山摇的惨景。 19日晚,因汪建已在灾区,王俊顶着余震连夜赶到成都,担负起华大在成都的相关指挥工作,协调与军方、万科企业集团及苹果基金会的诸多事宜。 20日,政府发布强烈余震的预报,大家都没有退缩,华大的顾问军事医学科学院原院长赵达生将军、华大基因负责与苹果基金会合作的陈芳、杨玲、王磊分别由深圳和北京赶到,负责与军队合作的刘利成也由北京来到成都;深圳华大基因研究院的两位司机马师傅、廖师傅也日夜不停将一辆丰田越野车送抵灾区。 20日晚,汪建乘坐军队的直升飞机安全返回,在飞机上看到原来的青山绿水已经变成了黄色的烂泥堆和黑水。回想半年前去卧龙途经映秀镇的青山绿水景色,令人倍觉凄凉和伤感。 晚上大家齐聚山友李新的新子云楼,根据前方信息,共商下一步的华大行动计划。 5月21日,大家兵分三路。赵院长、汪建、王俊与万科集团王石等一行去了绵竹的6个乡镇考察;万科投资1亿元重建绵竹县遵道镇,年内建成“抗震、节能、环保”的幼儿园、学校和医院;同时援建3个标准化的建材生产厂,生产建材送给当地灾后重建;并支援万人帐篷、2万人的板房区。一路上大家感受颇深,许多地方的学校、医院、居民区都毁于地震,但大家都没有被自然灾害打倒,幸存的灾区干部和群众化悲痛为力量,积极投入到灾后重建家园中;军队官兵在危难时刻冲在最危险和最需要救助的第一线,真正体验到了养兵千日,用兵一时的意义和解放军关心百姓疾苦的优良传统;大批的志愿者是有着无私爱心的最可敬的人,他们自备干粮长途跋涉来到灾区,只想贡献自己的一份爱心,为灾区百姓做些实事。我们还恰巧碰到了深圳山友三十多人组成的志愿者团队。老百姓感谢以胡锦涛主席和温家宝总理为代表的党和政府在这次灾难中的快速反应和全力救助,感谢解放军、志愿者,感谢全中国乃至全世界人民伸出的援助之手。灾区人民已经渐渐从震后的悲凉、凄惨、绝望中走出,奋起精神和全国人民万众一心,鼓起了重建家园的希望。 陈唯军、杨玲、王磊、刘利成等待由军事医学科学院副院长贺福初将军、院士带领的军队系统防疫队伍;防疫队中午到达双流机场,缺保障装备如发电机、探照灯、电源线等物质;我们紧急采购运抵机场,通过快速通道迅速送入机场;陈唯军加入军事医学科学院防疫队,连夜出发开往开展急需防疫工作的汶川县城。 5月22日上午,应映秀前方的要求,赵院长携带大量的必需物品奔赴灾区,汪建驾车陪同前往。王俊等人被留在成都协调其他事宜并待命。 下午,车接近映秀,空气中尸体的腐烂气味已经扑面而来。 日渐增高的气温,遇难者遗体,死亡禽畜的尸体腐败都在加快,尸蝇的生成也在加速,然而依然有部分灾民生活在地震废墟上,为传染病的预防带来了极大的压力。一些“流落”在外的家禽、家畜也成为可能的疫病传染源。 快速转移并安置灾民,及时消毒喷洒,特别是及时挖掘、消毒掩埋尸体,并积极进行主动的传染病监测和检测是预防重大传染病发生的当务之急。而整个映秀镇还有近千具尸体埋在废墟下面,由于缺乏重型机械而无法进行快速挖掘作业。 5月23日上午,在解放军工兵的夜以继日工作下,可通过重型车辆的道路和桥梁已经打通,大型机械开始进入现场,消毒喷洒、挖掘、消毒掩埋尸体成为主要工作,传染病监测和检测依然处于待命状态。当然,对传染病来说,没有事就是最好的事。汪建陪同赵院长回到成都。 5月23日下午,陈唯军参与的汶川防疫车队经由雅安—马尔康—理县—汶川800多公里历时三天到达汶川县城,其中理县—汶川沿线多次塌方,危情不断,50公里行程走了4个小时。 军事医学科学院的四位将军都对华大的积极主动参与疫情的主动监测表示了充分的肯定。但因前方暂无疫情发生,杨玲和刘利成只好在成都准备好一切检测试剂24小时待命。 华大在成都的同志也为军事医学科学院提供了大量的后勤服务工作,并将华大的军用吉普车给军队用,得到了前方将士的高度赞赏。 深圳华大基因研究院与万科企业集团的抗震救灾活动另见报道。 深圳华大基因研究院还与由山友王秋杨成立的北京苹果基金会密切合作,开展为灾区人民送医送药的活动。苹果基金会动用上百万的善款,采购了灾区急需的大量药品、医疗器材和生活物资。华大基因作为其长期合作伙伴,与其携手并肩共同深入一线灾区,参与相关救援工作。下面是此次加入苹果基金会抗震救灾活动的陈芳(车位少只能去一人)自前方发回的报道: 5月21日短信: 山上雾大、泥泞、能见度不到五米,有坏车开得很慢,可能还两个小时到达。明天主要在日隆镇及下面乡镇发药品物资,普及防疫知识。一路上只有赈灾车辆,大家都很友好,连警察叔叔都格外热情。 我还在进山的路上,晚上露营小金县日隆镇,现在达维桥头。山路下雪不好走。 5月22日短信: 日隆镇成空城了,没有信号,我们露营在马路上,很多房子毁了,但伤亡很小,昨晚我们赶到之前半小时又有强烈余震。今天分了药品下午去小金县城了解情况,已经分了六个村寨的药品和物资。 5月22日电话摘要: 昨晚(21日)没带睡袋,今日到达小金镇;小金镇70%-80%的民房损毁了,以前看到的景象都不存在了;四姑娘山全毁了,冰川都塌了;地震对四川旅游业造成了沉重打击;(还好)这边没有疫情,所有老百姓都住帐篷,明后天去其他镇,去卧龙,把药和防疫分给大家。 5月23日短信: 今天去了卧龙,找到熊猫基地的黄炎,留下一些药品物资。卧龙峡谷塌方严重,路况满危险的,我们给沿途村寨都分了药品、奶粉等,因为救灾中心的药分不到村里。救灾大米已经分发到各村,可是质量极差。现已回到日隆。2008-05-18 00:00:00.0
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科技部部长徐冠华、深圳市副市长刘应力视察深圳华大基因研究院
2008年4月19日下午,原科技部部长徐冠华、深圳市副市长刘应力等来深圳华大基因研究院视察,副院长王俊、李松岗等院领导接待了徐冠华部长及刘应力副市长一行,并向他们详细介绍和汇报了研究院各个实验室、技术平台、已经和正在开展的重大科研项目、以及研究院的发展战略与规划。徐冠华部长、刘应力副市长对研究院工作给予了充分肯定及赞许。2008-04-19 00:00:00.0
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盐田区政协主席李秀忠率70多位政协委员视察深圳华大基因研究院
2008年3月27日下午,深圳市盐田区政协主席李秀忠率70多位政协委员到我深圳华大基因研究院视察,研究院院长汪建,副院长王俊、李松岗等院领导接待了李秀忠主席一行,并向他们详细介绍和汇报了我院各个实验室、技术平台、已经和正在开展的重大科研项目、以及研究院的发展战略与规划。2008-03-27 00:00:00.0
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盐田区区委常委、宣传部长、区文化局局长罗为平视察我院
2008年3月25日下午,盐田区区委常委、宣传部长、区文化局局长罗为平,区政协办公室主任、贸工局局长陈高原率队来我院视察。随后,罗为平局长一行人来到万科篮球馆,与我院领导、员工进行了激烈的篮球对抗赛。2008-03-25 00:00:00.0