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世界首个鹅全基因组序列图谱绘制完成
2011年6月3日,浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所和华大基因在宁波市象山四季佳利酒店召开新闻发布会,宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱,这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础,鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅的起源、优良鹅种的选育等具有重要的科学价值。农业部全国畜牧兽医总站畜禽遗传资源处杨红杰处长、浙江省畜牧兽医局潘天银副局长、国家水禽产业技术体系遗传育种与繁殖研究室主任、浙江省农业科学院首席专家卢立志研究员、象山县浙东白鹅研究所所长、国家水禽产业技术体系宁波试验站站长陈维虎研究员、华大基因科技合作总裁尹烨、国家水禽产业技术体系专家(何大乾研究员、潘道东教授、沈军达站长)、宁波市畜牧兽医局徐震宇局长以及象山县等专家领导出席了本次发布会。 上午11点,新闻发布会在象山县人民政府副县长孙小雄先生的主持下正式开始。浙江省农科院卢立志研究员首先向大家介绍了鹅全基因组测序完成对促进浙东白鹅产业发展的重大意义,并表示将继续开展转录组、表观遗传学以及与其他地方品种鹅的比较基因组学等方面的研究。华大基因科技合作总裁尹烨指出:“每一个物种全基因组测序的完成都标志着该物种学科和产业发展的新开端,浙东白鹅基因组测序的完成势必会极大地推动浙东白鹅的遗传学研究和产业的发展”。随后,杨红杰处长为鹅基因组图谱绘制工作的圆满完成致贺词,他表示希望浙东白鹅基因组测序技术的成功经验能够应用于其他地方品种鹅的基因组研究。 浙东白鹅原产于浙江东部地区,是通过长期选育形成的浙江省地方独特的优良品种,已被列入《中国畜禽品种志》,其以肉质鲜美、早期生长速度快、风味独特著称。目前,浙东白鹅主产区象山县饲养量达250万只,是当地农业的主导产业之一。在加快推进规模化养殖的同时,浙东白鹅的产业化体系建设也在不断发展,基本形成了一条技术研究推广、生产合作和加工销售的浙东白鹅产业链。浙东白鹅全基因组序列图谱的完成为从分子水平深入了解浙东白鹅的生长性能、肉质和繁殖规律等种质特性奠定了坚实基础,同时也为浙东白鹅地方优良品种的保护和选育以及繁殖力的提高提供了理论依据,必将会促进浙东白鹅产业的进一步发展。 鹅全基因组序列图谱绘制主要由浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所和华大基因共同主持完成,基因组大小约为1.2Gb。该项目采用目前最先进全基因组鸟枪法测序(WGS)策略,分别构建了170bp、500bp、800bp、2kb、5kb、10kb和20kb等不同插入片段长度的文库,进行双末端测序,得到数据总量约为139Gb的原始数据。华大基因通过自主研发的SOAPdenovo软件进行了拼接组装。全基因组鸟枪法测序(WGS)策略具有速度快、简单易行、成本较低的优点,目前已经被广泛应用于测定动植物基因组序列,如水稻、熊猫、黄瓜、牡蛎、半滑舌鳎、石斑鱼、朱鹮等。进一步的比较基因组学分析,将对揭示中国家鹅的起源、地理迁徙、生态演化提供直接重要的科学证据,同时也对从基因组分子序列、基因层次研究家鹅物种改良、肉质改善、适宜饲养条件的探索奠定基础。2011-06-03 00:00:00.0
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武汉华大考察团回访咸宁 商谈健康项目战略合作
2011年6月2日,应湖北省咸宁市政府之邀,由武汉华大核心骨干组成的考察团一行5人回访咸宁。在咸宁市政府的组织安排下,考察团就开展医学健康项目战略合作与参会各市局代表进行探讨交流。 上午,咸宁市政府组织召开专题座谈会,咸宁经济开发区工委书记、管委会主任周亨华、咸宁市政府副秘书长胡建、科技局局长鲍晓峰、卫生局局长汪玲珑、外事侨务办公室党组书记陈红卫、咸宁经济开发区工委副书记、管委会副主任、市招商局局长乐建瞬、市委办公室副主任胡雅南、咸宁经济开发区管委会副主任陈洪豪、招商局局长雷伟民、咸宁市招商局纪检组长黄四生等领导出席会议。会上,华大基因华中区负责人牟峰向与会领导汇报了武汉华大HLA高分辨分型、宫颈癌HPV筛查、无创产前基因检测、HBV乙肝病毒耐药基因分型检测等医学健康项目的开展情况,并就与咸宁市政府联手开展大规模宫颈癌HPV筛查等民生项目进行了深入交流。 中午,中共咸宁市委书记黄楚平、市长任振鹤、副市长王汉桥等市委、市政府领导宴请武汉华大考察团。黄楚平书记表示,将尽最大的努力、最大的支持、最大的配合,组织协调咸宁市政府及各市局部门,落实开展与武汉华大的战略合作,让武汉华大在医学健康领域新技术尽快在咸宁市普及应用,造福咸宁百姓。 华大宣传部2011-06-03 00:00:00.0
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湖北省委党校第四十六期省直处干班学员参观武汉华大
2011年6月1日下午,湖北省省委党校第四十六期省处直干班学员一行20余人,在中新科技园办公室江中平主任的陪同下来访参观武汉华大。 参观中,来宾们对华大近年来在人类健康和生命科学两大领域开展的项目兴趣浓厚,询问了解了生物基因在百姓生活中的普及应用情况,高度评价了武汉华大HLA高分辨分型、宫颈癌HPV筛查、无创产前基因检测、HBV乙肝病毒耐药基因分型检测等新技术,对武汉华大开展的各产业化项目表示肯定与支持。2011-06-02 00:00:00.0
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基因组分析结果揭示新型超毒性大肠杆菌导致德国疫情爆发
6月2日,深圳华大基因研究院、德国汉堡大学医学院、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所联合研究揭示德国疫情是由一种新型具有超级毒性的大肠杆菌引起的,该新型菌株携带多种耐抗生素的特异基因,致使其难以治疗。据德国卫生部公布的数据,这场大肠杆菌疫情至今已导致17人丧生,欧洲已有超过千人受到感染,并且疫情有可能会进一步恶化。 德国大肠杆菌疫情爆发之后,华大基因立即建立联系开展合作,自发地加入到这场与疾病的研究中,成立专门研究小组对该细菌进行测序和生物信息学分析,以便尽快寻找到致病机理,研发有针对性的治疗措施并有效的控制疫情的蔓延。在获得病毒样本后三天的时间内,华大基因完成了对该新型大肠杆菌的基因组测序。经过初步信息分析,发现该菌株是一种新的兼具侵袭、产毒、肠出血等特征的大肠杆菌。 华大基因利用第三代测序仪——Ion Torrent进行了该大肠杆菌的全基因组测序,初步组装结果预测的菌株基因组大小为5.2Mb。通过对序列的分析发现该菌株属于血清型O104,但O104型大肠杆菌以前未见引起人类感染大规模爆发的报道。通过进一步比对分析发现该菌株与2002年从中非艾滋病患者腹泻标本中分离的肠侵袭性大肠杆菌55989菌株的同源性超过93%。根据对基因序列的分析结果显示,导致疫情爆发的菌株通过基因水平转移获得了肠出血性大肠杆菌的毒力基因和毒力相关质粒,可能与该菌株强毒性和重症感染有关。研究还发现,该菌株携带氨基糖甙类、大环内酯类、磺胺类等抗生素的耐药基因,导致抗生素治疗无效。研究小组还将进一步分析这些毒力相关基因的完整性和表达情况,及耐药和毒力基因水平转移机制,并在更多爆发菌株中进行验证。后期分析结果请关注后续报道。 该菌株的基因组序列已上传至NCBI数据库,编号SRA037315.1。2011-06-02 00:00:00.0
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江苏省委书记罗志军率领江苏省党政代表团参观华大
2011年6月1日下午,由江苏省委书记罗志军率领的江苏省党政代表团参观考察深圳华大基因研究院,中共广东省委常委、深圳市委书记王荣,广东省深圳市委副书记、市政府市长、党组书记许勤,广东省深圳市委常委、市委秘书长王毅等领导陪同考察。深圳华大基因研究院院长汪建、深圳华大基因研究院副院长王俊等予以热情接待。 参观中,汪建院长向江苏省党政代表团及深圳市领导们详细介绍了华大的发展历程与科研成就。特别是华大在人才培养、技术力量、科研产业等方面取得的重大成果。汪建院长说,作为世界上最大规模的基因组学研究中心,华大基因建立了大规模测序、生物信息等技术平台,测序能力及基因组分析能力世界领先,并推动克隆育种、健康服务、农业基因组等方向的应用。 江苏省党政代表团及深圳市领导们一行80余人重点考察了华大的分子育种、克隆猪、轻木、新型教育模式等成果展示,并了解了华大在发展人类医学健康产业化项目所取得的长足进步。 罗志军书记在询问华大目前基因测序能力时,汪建院长说,去年华大基因测序能力超过全美国测序能力总量,计算能力世界第一。一个物种基因序列图的完成,就意味着这一物种科研和产业革命性的新开端。华大在《自然》、《科学》发表的科研论文带来的产业价值将是科研投入的十倍、百倍。 汪建院长表示,华大抓住了国家“十二五”规划提供的良好发展机遇,希望在国家政策法规的支持下可以更加快速的开展民生项目,服务百姓,造福社会。 罗志军书记对深圳市领导发出邀请,希望华大能入驻江苏。汪建院长对此表示感谢,并强调华大会积极开展交流,促进合作。2011-06-01 00:00:00.0
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华大光琇医学基因组学联合实验室正式成立
2011年5月31日,武汉华大基因与湖南光琇高新生命科技有限公司签订战略合作协议,华大光琇医学基因组学联合实验室正式成立,并接收到了第一份无创产前基因检测样本。 据悉,华大光琇医学基因组学联合实验室是由武汉华大与湖南光琇高新生命科技有限公司共同组建,无创产前基因检测是联合实验室第一个推向临床应用的服务项目。双方通过联合实验室共同推进人类医学基因组学科学研究、技术开发,加速医学基因组研究成果的市场化和产业化,促进医学基因组学的临床应用,全力实现“科研、技术、产业、教育”的全面发展,为人民健康保驾护航。 附: 卢光琇简介 主任医师,教授,医学遗传学、发育生物学、干细胞工程学、生殖工程学和医学伦理学专业的博士生导师,我国人类生殖工程领域的奠基人和开拓者之一。现任中信湘雅生殖与遗传专科医院院长,人类干细胞国家工程研究中心主任,中南大学生殖与干细胞工程研究所所长,湖南中国遗传医学中心副主任,国家精子库技术指导中心主任,湖南省干细胞工程技术研究中心主任、全国生殖健康专家组成员、全国产前诊断专家组成员、中国优生优育协会理事、中华医学会湖南省副会长等学术职务。并担任全国政协常委和湖南省政协副主席等社会职务。 湖南光琇高新生命科技有限公司简介 湖南光琇高新生命科技有限公司的名称源于我国著名生殖与遗传学家卢光琇教授。卢教授是我国人类生殖工程创始人之一,在辅助生殖技术和干细胞研究领域具有很大的影响力。 而湖南光琇高新生命科技有限公司所属的人类干细胞国家工程研究中心将完成国家干细胞中心的基本建设,包括干细胞研发中心、干细胞移植中心,为干细胞技术的开发和发展提供基础设施,并将按照现代企业制度的要求,完善治理结构,积极推动干细胞技术产业化;建立符合临床应用的人类胚胎干细胞库,形成建库规范,推进胚胎干细胞的临床应用,参与国际化合作,增强我国胚胎干细胞科研在国际上的竞争力;同时还将建立中南地区最大的成体干细胞库及干细胞移植医院,将干细胞治疗推向临床,首先用于治疗现代医学和传统医学都束手无策的疑难杂症,如各种遗传性疾病、脊髓和脑外伤、糖尿病、脑瘫等,为国家三类医疗技术提供干细胞领域的技术规范。 华大华中区负责人牟峰与光琇高新院长卢光琇签订战略合作协议 华大华中区商务负责人汪德鹏与光琇高新副院长林戈交接第一批无创产前基因检测样本2011-06-01 00:00:00.0
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湖北省计生委领导到访武汉华大 商谈医学健康项目全面合作
2011年5月31日上午,湖北省人口和计划生育委员会科技服务中心主任吴少斌、科技处李辉一行来访武汉华大,华大基因华中区负责人牟峰予以热情接待。 参观中,吴少斌主任了解了武汉华大近期在产业发展方面的最新进展,询问了HLA高分辨分型、宫颈癌HPV筛查、无创产前基因检测、HBV乙肝病毒耐药基因分型检测等医学健康新技术的应用情况。 座谈中,双方就运用资源技术优势开启全面合作进行了探讨交流。据了解,省计生委与武汉华大将于近期签订全面合作框架协议。在科学研究方面,武汉华大将利用在生物信息分析的技术优势,与省计生委将共建疾病数据库;在医学临床应用方面,双方力求通过合作将医学健康新技术普及应用到各项民生工程中,造福百姓。同时,双方将加强在单基因病领域的研究合作,进一步提高湖北省人口质量,加强优生优育工作。2011-06-01 00:00:00.0
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湖北省妇幼保健院胡祖斌院长来访武汉华大 双方将联手开展医学健康项目
2011年5月27日下午,湖北省妇幼保健院胡祖斌院长在武汉国家生物产业基地建设管理办公室总工程师冯立的陪同下来访武汉华大基因,华大基因华中区负责人牟峰予以热情接待。 参观中,负责人牟峰介绍了武汉华大正在开展的HLA高分辨分型、宫颈癌HPV筛查、无创产前基因检测、HBV乙肝病毒耐药基因分型检测等产业化项目,以及高通量测序仪的运行情况。 座谈中,双方就深入合作、共同开展医学健康项目进行了深入探讨交流。胡祖斌院长表示,湖北省妇幼保健院每年有近一万名新生儿,需要武汉华大提供相应的技术支持,减少痴呆儿出生,减轻社会负担。近期将与武汉华大强强联手、共同筹建临床研究中心,利用双方的技术和资源满足临床需求,并将成果应用在湖北省及各个市区,推动湖北省在医学健康领域的发展。 最后,胡祖斌院长表示,湖北省妇幼保健院愿与武汉华大建立起人才互派机制,培养医学健康高素质人才。2011-05-30 00:00:00.0
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华大生命伦理和生物安全审查委员会赴北大交流——探索高水平研究之路
2011年5月26-27日,华大生命伦理和生物安全审查委员会(以下简称“伦理委员会”)主席郭肇铮、副主席冯小黎等一行应邀参加了北京大学生物医学伦理委员会的年度培训研讨会。 研讨会期间,华大人以孜孜以求的态度聆听了来自Duke大学资深专家 Dr. John Falletta 和 Dr. Judy Power对人类受试者保护项目的阐述,认真学习了国家人类遗传资源办公室陈洁君博士对人类遗传资源管理办法的介绍,并进一步了解了北京大学生物医学伦理委员会的工作经验和成长历程。 作为特邀嘉宾,郭肇铮老师介绍了华大的研究工作、研究者在实践中锻炼起来的科研伦理意识和规范操作、以及当前伦理委员会建设攻关阶段的主要工作和挑战。郭肇铮老师一席诚恳的交谈赢得了在场研究者的积极响应,并在与会间与国内外的专家进行了深入的交流与探讨。 继郭肇铮老师3月观摩北京大学生物医学伦理委员会审查会议后,华大伦理委员会成员观摩了27日召开的5月审查会议。北京大学生物医学伦理委员会的工作模式给参会的华大人留下了深刻印象,会后,就如何在华大开展受试者保护、伦理审查工作,郭肇铮老师、冯小黎老师一行与北京大学生物医学委员会主席丛亚丽老师以及外国专家进行了更加深入的探讨。Dr. John Falletta 最后期许到:“如何将受试者保护工作、伦理审查工作做好,是体现研究机构综合研究水平的重要课题。世界一流的研究机构,如华大基因,应当起到全面提高中国科研工作水平的示范作用,给世界以惊喜。” 郭肇铮老师表示,通过提炼同行的实践智慧、紧跟国际国内伦理规范和伦理审查工作要求、加强与北京大学、Duke大学等伦理委员会的交流与合作,我们有信心使华大受试者保护工作和伦理审查工作快速、健康地成长,赢取受试者信任以及学界、社会的全面认同,为华大今后的科学知识向临床、产业化发展保驾护航,在国内外创造一个有强大生命力和号召力的产学研一体化的创新品牌。 撰稿:华大生命伦理和生物安全审查委员会秘书处暨华北片区办公室2011-05-27 00:00:00.0