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  • 中国科学院植物研究所和华大基因共同完成甜高粱基因组序列多态性分析——研究成果于《基因组-生物学》杂志发表
    由中国科学院植物研究所、华大基因和新加坡淡马锡研究所共同完成的甜高粱基因组变异研究成果(Genome-wide patterns of genetic variation in sweet and grain sorghum (Sorghum bicolor))于2011年11月21日在国际著名杂志《基因组-生物学》(Genome-Biology)上在线发表(http://genomebiology.com/2011/12/11/R114/abstract)。该研究成果为深入挖掘甜高粱优良性状基因以及促进遗传育种改良等研究提供了非常有价值的参考。 高粱是世界上第五大禾谷类作物,在干旱、半干旱地区农业生产中占有极其重要的位置。甜高粱是高粱的一个自然变种,同普通籽实高粱相比有着诸多独特的生物学和农艺学性状,如高光合效率、大生物量和更强的耐逆性等。甜高粱还因高秸杆含糖量,成为我国和世界发展第1、2代生物质液体燃料的重要作物。2009年,美国能源部联合基因组研究所就已完成高粱的全基因组测序,使高粱成为继水稻之后第二个被测序的禾本科植物,但有关甜高粱和普通籽实高粱在基因组水平的差异尚未有深入研究。 在此次发表的成果中,研究人员利用新一代高通量测序技术,对2个甜高粱和1个中国籽实高粱品系进行了全基因组重测序及生物信息学分析。经与已知的籽实高粱基因组序列比较后,发现甜高粱和籽实高粱在近1,500个基因中存在序列和结构差异,这些基因的功能涉及糖与淀粉代谢、木质素和香豆素合成、核酸代谢、胁迫应答和DNA修复等活动。同时,研究人员还发现了1,057,018个单核苷酸序列多态性位点(SNPs),99,948个小片段(1-10bp)缺失(Indels),16,487个获得和缺失变异(PAVs)以及17,111个拷贝数变异(CNVs)。这些结果对研究人员下一步深入研究基因组变异如何影响生物学性状,建立基因与性状的关联分析以及开展高粱育种改良等方面的研究具有很大的帮助。 文章第一作者、华大基因该项目的负责人郭小森研究员说:“本次研究主要阐释了甜高粱和籽实高粱在基因组水平上的差异,之后我们将会进一步对这些差异进行深入研究,希望我们的工作能为揭示甜高粱重要的生物学特性奠定坚实的分子遗传学基础,并进一步对甜高粱的育种改良,以及为探寻更加优秀的生物能源来源起到积极的推动作用。”
    2011-12-02 00:00:00.0
  • 荷兰奈梅亨医学中心人类遗传学系Ad Geurts van Kessel教授来访 探讨未来合作
    2011年11月29日,荷兰奈梅亨医学中心(Radboud University Nijmegen Medical Centre)人类遗传学系,肿瘤基因组学研究负责人Ad Geurts van Kessel教授和Roland P. Kuiper助理教授一行来访华大基因。华大基因院长汪建,欧洲华大负责人李宁,生育健康中心负责人王威,亚太区第一负责人梁鸿生及科学团队负责人李英睿等予以热情接待。 在随后举行的座谈会上,双方介绍了各自医学研究和应用的主要内容和方向,并就未来在临床研究、应用方面的合作内容与模式进行了深入地探讨。
    2011-11-30 00:00:00.0
  • 华大基因和NimbleGen联合研发出最新人类MHC区域捕获技术
    2011年11月28日,华大基因和罗氏NimbleGen公司联合宣布已成功研发出全新人类MHC区域捕获技术,该技术突破了常规扩增和捕获方法的瓶颈,首次成功实现了对人类MHC区域的高度覆盖及有效富集。全新MHC捕获技术和新一代高通量技术的完美结合,将有助于科研人员从基因水平深入探究与MHC区域相关疾病的病因及遗传机制,对生物医药产业的发展具有极大的推动作用。 据了解,该技术捕获的区域不仅覆盖了传统的3.37Mb、MHC区域,并且还向上下游共扩展了约1.60Mb的区域,共计4.97Mb(chr6: 28477797-33448354),此外,该区域还包涵了目前已发现的MHC区域8个单体型信息。在覆盖度方面,该技术可覆盖高达97%以上的MHC区域,并且对mRNA区域更是实现了几乎100%的覆盖。在准确性方面,该技术检测的MHC区域的SNP位点与基因分型技术检测的SNP位点的一致率高达99.42%,并且还可挖掘到更多新的SNP信息。 主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC),在人类中又称为人类白细胞抗原系统 (Human Leukocyte Antigen,HLA),位于第6号染色体短臂上,该区域包含约150个可表达基因,其基因密度(37个/Mb)是全基因组平均基因密度(7个/Mb)的5倍,是人类基因组中最复杂的多态性区域。MHC区域广泛参与免疫应答的诱导与调节,激发机体特异性免疫反应,在免疫学上具有极为重要的意义。目前已发现包括自身免疫疾病、癌症、多种复杂疾病等至少百余种疾病均与此区域的多态性位点及变异相关。此外,该区域的多样性被认为与进化的多样性有关,加上其存在连锁不平衡和单体型遗传的现象,因此还常被用于群体进化、亲子鉴定和移植配型等研究。 华大基因研究人员蒋慧说:“我们与罗氏NimbleGen公司合作研发的全新MHC区域序列捕获技术,主要对探针设计和捕获流程进行了优化,极大地提高了对MHC区域的覆盖度和捕获效率。此外,该技术还加强了对pooling技术的优化,可实现多样品的有效捕获,极大的节约了研究成本。MHC捕获技术与新一代高通量测序技术的高效结合,必将为人类疾病及医药研发等相关领域带来更多新的发现。”
    2011-11-28 00:00:00.0
  • 汪建院长考察广州大学城 探讨生物健康产业发展新模式
    2011年11月25日下午,深圳华大基因研究院院长汪建携华南区第一负责人尹烨、华南区第二负责人彭智宇等应邀前往广州市大学城访问考察。广州市番禺区区委书记卢一先、区长楼旭逵、副区长林伟长、广州大学城健康产业产学研孵化基地总经理金维刚等予以热情接待。 在楼旭逵区长主持下,华大访问团听取了广州大学城生物医药健康产业发展状况及广州大学城发展规划。针对番禺区提出的欢迎华大入户广州大学城的邀请,汪建院长表示,华大基因将坚持“产学研”一体化发展模式,充分利用广州得天独厚的医疗、教育资源,以降低出生缺陷、幸福华南、引领生物医药健康产业发展为目标,在广州设立华大基因华南区总部。随后,汪院长给全区领导作《基因引领未来》的专题报告。报告中,汪建院长提出“不跟鬼佬起哄”、“建立中国人的参考数据库”、“建立中国的国际标准样品库”、“发表里程碑式科研论文”、“建立全球标准、国际标准”等经验总结,引发在座听众的共鸣与深思。 随后华大访问团与广州市番禺区区委书记卢一先会面。卢一先书记对华大访问团一行的回访表示热烈欢迎,希望华大基因在番禺区设立华南区总部,共同为广州生物医药健康及教育产业发展做贡献。
    2011-11-27 00:00:00.0
  • 汪建院长出席2011CCTV中国经济年度人物深圳论坛
    2011年11月26日下午,由中央电视台财经频道举办的2011CCTV中国经济年度人物深圳论坛在深圳香格里拉酒店隆重举行。本次论坛以“高新技术产业的新推动力”为主题,2010CCTV中国经济年度人物得主——华大基因研究院院长汪建出席了本次论坛。 本次论坛汇集了深圳领导、著名经济学家、往届年度人物、商界领袖等。深圳市委副书记、市长许勤、经济学家胡祖六、往届CCTV中国经济年度人物得主——华大基因研究院院长汪建、深圳市创新投资集团有限公司董事长靳海涛、广东明阳风电产业集团总裁张传卫等齐聚中国第一个经济特区——深圳,以领军者的智慧解析中国经济,寻找全球变革中的可持续动力。 据了解,CCTV中国经济年度人物评选历经十一年光荣与梦想,共评选出110多位中国经济年度人物,这些年度人物在中国经济的舞台上已经成为了动力之源和活力之源。 论坛围绕深圳发展高新技术产业的最大优势、中国制造是否正在遭受严冬、中国高新技术产业的突破点、中国是否会诞生自己的苹果公司等相关中国经济热点问题展开讨论。 本节目将于2011年12月7日23:10在中央电视台二套财经频道播出,敬请关注。
    2011-11-27 00:00:00.0
  • 汪建院长率团应邀赴川渝考察访问 全面开启华大华西战略布局
    2011年11月20日至24日,华大基因研究院院长汪建应重庆市政府、四川省科技厅等政府及院校之邀,率华大基因华西区负责人牟峰、华大生育健康中心负责人王威、重庆华大筹建负责人曹洋考察走访重庆、成都等地,全面开启华大基因华西区的战略布局。 11月21日上午,在重庆市副市长吴刚组织协调下,汪建院长一行会见了重庆市发改委副主任罗清泉、重庆市科学技术研究院副院长皮晓青及发改委、研究院相关部门的领导专家,双方就运用华大基因世界领先的基因测序和生物信息分析能力为提升重庆科技实力、带动重庆新兴技术产业、推动重庆公共健康、发展重庆医疗卫生事业进行了深入探讨。 11月24日上午,在四川省科技厅副厅长周孟林、副厅长陈放的组织安排下,汪建院长一行与四川省相关职能部门领导、农林医药等相关领域专家就华大基因在川发展进行了会谈。汪建院长表示华大基因将结合四川省丰富的物种及医学资源,为四川省的生命科学发展提供全新、一流的科学技术平台,推动四川省的科研及产业发展,提升当地的医疗水平,造福人民百姓。 考察期间,汪建院长分别在重庆医科大学、中国人民解放军第三军医大学、四川大学举行了大型专题演讲会,并与重庆医科大学校长雷寒、副校长黄爱龙、副校长杨竹,第三军医大学校长罗长坤,四川大学生命科学学院肖智雄院长、副院长林宏辉等高校领导专家进行亲切座谈,就科研合作、人才培养进行了深入探讨并达成意向性协议。此外,汪建院长一行应邀到访重庆医科大学儿童医院、华西妇女儿童医院进行座谈交流,并与两家医院达成初步合作意向。华大基因将联手重庆医科大学附属儿童医院、华西妇产儿童医院,以研究相对简单的单基因遗传代谢性疾病为切入点,优化利用医院临床资源、专业知识优势和华大基因生物基因组学科研实力,与欧美一流研究机构开展合作,在中国寻找相应病例进行深入研究,共同发表科研论文、快速确立国际标杆地位,并逐渐建立完善临床标准。
    2011-11-26 00:00:00.0
  • 重庆两江新区工业开放区管委会副主任刘风一行到访华大 探讨双方合作事宜
    2011年11月26日下午,重庆两江新区工业开放区管委会副主任、重庆两江集团副总裁刘风、重庆两江新区驻深圳办主任倚胤发、两江新区服务业促进局副局长李伟等一行来访华大参观与座谈,医学健康事业部负责人易鑫热情接待来宾。 参观中,医学健康事业部负责人易鑫为来宾介绍了华大基因的发展历程、科研成果、健康民生项目、人才培养与教育规划等内容。在健康服务区,重庆两江新区工业开放区管委会副主任刘凤表现出对无创产前基因检测技术的兴趣,并详细了解这项技术操作和应用的相关情况。 随后,双方就重庆两江新区携手华大基因,共谋科技创新发展等问题展开热烈探讨。刘凤副主任诚邀华大参观重庆两江新区,并表示愿尽最大努力满足华大基因落户要求,以促成双方合作展开.
    2011-11-26 00:00:00.0
  • 青岛市高新区领导来访 加快推进国家基因库海洋库落地
    2011年11月25日上午,青岛市国土局处长庞兵锋、青岛高新区管委主任赵兴书、管委副主任赵士玉、高新区经济发展局局长隋斌、高新区财政局局长陈铭传、高新区投资促进局局长薛润波、高新区规划局局长姜德志、高新区国土局局长杨浩、高新区投资促进局处长朴志刚等一行来访华大。华大基因研究院院长汪建、蛋白平台及国家基因库重大专项负责人张勇、海洋平台负责人石琼等热情接待了来宾。 来宾参观了华大展区、华大海洋生物平台、测序服务平台以及信息技术平台,对华大各方面的发展情况有了一个直观而全面的了解。 在交谈中,汪建院长表示,青岛地理环境得天独厚,海洋生物资源丰富,在青岛建立国家基因库海洋库具有战略意义。来宾表示,此次参观华大感到非常震撼,华大致力于生命起源的研究,对人类贡献很大,同时来宾转达青岛市委市政府的亲切问候,青岛市委市政府领导非常重视海洋库的建立,希望加快推进建设,青岛市高新区会在各方面做好服务。
    2011-11-25 00:00:00.0
  • 武汉华大联手河南省疾控中心解密“蜱虫病”致病元凶 研究成果于《PLoS Pathogens》杂志发表
    由河南省疾病预防控制中心、武汉华大基因等多家单位合作完成的“发热伴白细胞和血小板减少综合症”(俗称蜱虫病)病原体研究成果于2011年11月17日在国际著名杂志《公共科学图书馆-病原体》(PLOS Pathogens)上在线发表。在此项研究中,研究人员主要通过宏基因组学研究方法对一种新型布尼亚病毒进行了研究,并推测其可能为“蜱虫病”的主要元凶,为蜱虫病的预防控制、临床诊断治疗等提供了有力的科学依据。 近两年来,我国部分地区相继发现一些蜱虫叮咬所致的病例,尤其是2010年的河南蜱虫中毒事件引起了大家的普遍关注。据统计,自2007年5月至2010年9月8日,河南省共监测发现发热伴血小板减少综合征病例达557例,其中死亡18例。而同期在山东等地亦有致病及致死病例被通报,引起国内各卫生部门的高度重视。人在经蜱虫咬伤后,会出现发热、胃肠道症状、血小板减少和白细胞减少为主要临床表现,少数患者会因多器官衰竭而死亡。 在本研究中,科研人员从一个蜱虫病重症患者的血液样本中分离出一种新的病毒,并将其命名为“河南发热病毒”(Henan Fever Virus, HNV virus),通过鉴定后确定该病毒为一种新型布尼亚病毒,与第一种布尼亚病毒----Uukuniemi病毒在遗传结构上最为相似。经过深入研究后,科研人员发现该新型布尼亚病毒与蜱虫病具有非常高的相关性。该研究团队还快速研制出新型布尼亚病毒的诊断试剂盒,并启动了疫苗研发,为该疾病的临床诊断及预防控制提供了有效支撑。 武汉华大基因负责人牟峰博士说:“与传统发现新病原体的方法相比,宏基因组学研究方法可直接检测病菌样本,具有快速、高效的优点。该方法与流行病学调查相结合,可以更加快速诊断未知疾病,并可将其与其他具有类似症状的疾病区分开。” 河南省疾病预防控制中心副主任、中澳健康合作项目首席科学家、河南省医学科学科技重大课题负责人许卞利教授表示:“该研究成果不仅对蜱虫病的预防控制、临床治疗及病原体的进化起源打下坚实基础,更为重要的是为建立全球范围的新发、突发传染性疾病的快速应对机制提供了一个新思路。” 文章链接: Metagenomic Analysis of Fever, Thrombocytopenia and Leukopenia Syndrome (FTLS) in Henan Province, China: Discovery of a New Bunyavirus
    2011-11-25 00:00:00.0
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